157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0680 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0680  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 219 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0689  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  99.09 
 
 		 219 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  94.52 
 
 		 217 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.98 
 
 		 203 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0733  cold shock domain-contain protein  57.08 
 
 		 203 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.93 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.26 
 
 		 192 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.64 
 
 		 204 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.18 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 205 aa  221  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0580  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.37 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3678  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0441  cold-shock protein, DNA-binding  41.98 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4295  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.21 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.01 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  35.05 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  32.09 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  32.09 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3278  hypothetical protein  32.7 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0154434  hitchhiker  0.000533264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4786  putative cold-shock protein, DNA-binding  38.61 
 
 		 104 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548437  normal  0.675436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3425  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.35 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1043  hypothetical protein  66.67 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355222  normal  0.453598 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1486  cold-shock protein  50.79 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4616  hypothetical protein  63.27 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.825297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.18 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0693  hypothetical protein  60 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2336  hypothetical protein  36.54 
 
 		 111 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.900928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2151  cold-shock domain-contain protein  46.75 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01686  cold shock domain protein  57.78 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1911  hypothetical protein  69.44 
 
 		 87 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1841  Excalibur domain protein  50 
 
 		 102 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1356  cold-shock DNA-binding domain protein  40.24 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3705  Excalibur domain-containing protein  31.25 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1327  cold-shock DNA-binding domain protein  40.24 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2028  cold shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0321  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0396  hypothetical protein  56.1 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2865  hypothetical protein  37.18 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00327413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0292  guanine-specific ribonuclease  27.48 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3336  hypothetical protein  36.23 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  54.05 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.984456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3494  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0199101  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1832  cold-shock DNA-binding domain protein  38.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3072  cold-shock protein, DNA-binding  23.26 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2624  hypothetical protein  60 
 
 		 34 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2176  hypothetical protein  43.33 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979062  normal  0.0387048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0400  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.666449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0927  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  51.35 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3723  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0148  cold shock DNA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6292  cold-shock DNA-binding domain protein  41.43 
 
 		 67 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.392497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3143  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 68 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1893  cold-shock protein DNA-binding  44.07 
 
 		 69 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1810  cold-shock DNA-binding domain protein  37.88 
 
 		 69 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2966  hypothetical protein  35.06 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4272  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 66 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217345  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1752  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.27 
 
 		 68 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3653  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 80 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.820165  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4677  cold-shock DNA-binding domain protein  35.94 
 
 		 69 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.403947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5491  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 69 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599855  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0591  cold-shock DNA-binding protein family protein  35.29 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1345  cold-shock DNA-binding domain protein  37.29 
 
 		 69 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0495  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5162  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 69 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4533  cold-shock DNA-binding domain protein  38.98 
 
 		 69 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1185  cold-shock protein DNA-binding  37.29 
 
 		 69 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4164  cold-shock protein DNA-binding  38.98 
 
 		 69 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0812  cold-shock DNA-binding domain protein  40.38 
 
 		 69 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.674883  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5567  cold shock protein  41.38 
 
 		 70 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197261  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5433  cold-shock DNA-binding domain protein  41.54 
 
 		 67 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0949203  hitchhiker  0.00613475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3086  cold shock protein  39.71 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  38.98 
 
 		 68 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.741556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4422  cold-shock DNA-binding domain protein  42.65 
 
 		 69 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0142  cold shock protein  39.66 
 
 		 74 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5928  cold-shock DNA-binding domain protein  40.62 
 
 		 69 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0895  cold-shock DNA-binding domain protein  39.66 
 
 		 63 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1412  cold-shock DNA-binding domain protein  25.93 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5163  cold-shock DNA-binding domain protein  41.54 
 
 		 67 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  0.551155 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  43.75 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2482  cold-shock DNA-binding domain protein  28.75 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6591  cold-shock DNA-binding domain protein  40.35 
 
 		 69 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  35.29 
 
 		 66 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5655  cold-shock DNA-binding domain protein  40.35 
 
 		 69 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2034  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 67 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0093  cold-shock DNA-binding domain protein  44.07 
 
 		 69 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3306  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.73 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2851  hypothetical protein  36.73 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1397  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.25 
 
 		 73 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0666799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0078  cold-shock DNA-binding domain protein  40.62 
 
 		 69 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.176991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0846  cold-shock DNA-binding domain protein  40.91 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.012505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0886  cold-shock protein DNA-binding  40.91 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3853  cold-shock DNA-binding domain protein  48.65 
 
 		 69 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  35.29 
 
 		 66 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5157  cold-shock DNA-binding domain protein  41.38 
 
 		 63 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 68 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.976411  normal  0.373537 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>