More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3723 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3723  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3142  cold-shock DNA-binding protein family protein  50 
 
 		 267 aa  150  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2344  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.14 
 
 		 249 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2901  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.15 
 
 		 288 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5022  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  81.54 
 
 		 69 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.499823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0105  cold-shock DNA-binding domain protein  40.12 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.310654  normal  0.194385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2005  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 69 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6274  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 		 69 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4283  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.46 
 
 		 68 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6033  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.56 
 
 		 69 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.263263  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5928  cold-shock DNA-binding domain protein  76.92 
 
 		 69 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1345  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 69 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1185  cold-shock protein DNA-binding  74.63 
 
 		 69 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4677  cold-shock DNA-binding domain protein  75.76 
 
 		 69 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.403947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1810  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 69 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4533  cold-shock DNA-binding domain protein  73.53 
 
 		 69 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5655  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 69 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4164  cold-shock protein DNA-binding  73.53 
 
 		 69 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6591  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 69 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2980  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 73 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0073832  normal  0.0936276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0841  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 69 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1492  cold-shock family protein  73.85 
 
 		 69 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.136425  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0078  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 69 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.176991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1892  cold-shock protein DNA-binding  74.63 
 
 		 69 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0977  cold-shock DNA-binding family protein  70.15 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.717834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0093  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 		 69 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1676  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 69 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00586625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5491  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 69 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599855  normal  0.0633447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4458  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 		 69 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0812  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 69 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.674883  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5162  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3161  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 69 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161902  normal  0.108125 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5421  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 68 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0142  cold shock protein  72.31 
 
 		 74 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0846  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 69 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.012505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0886  cold-shock protein DNA-binding  73.85 
 
 		 69 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1446  cold-shock family protein  73.02 
 
 		 105 aa  104  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.215876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3705  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75 
 
 		 70 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.59949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1893  cold-shock protein DNA-binding  73.44 
 
 		 69 aa  104  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5378  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.260469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1791  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 70 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3513  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 70 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4194  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 70 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.69443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7022  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.44 
 
 		 70 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  0.604228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0311  cold-shock protein, DNA-binding  73.44 
 
 		 68 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0810  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 68 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1798  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 69 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 68 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0850  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 		 68 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2375  cold-shock protein, DNA-binding  71.21 
 
 		 69 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0386  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 68 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1056  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 70 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.102694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0246  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0217  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 69 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2533  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 69 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0809  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 69 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0922  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 69 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11423  normal  0.220498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 		 68 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.741556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 69 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2974  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42307 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0430  cold-shock family protein  71.21 
 
 		 69 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1949  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 69 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589262  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2279  cold-shock DNA-binding domain protein  39.56 
 
 		 310 aa  99  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.703886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 69 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.084577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4174  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.31 
 
 		 192 aa  98.2  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2846  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.12 
 
 		 73 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.495681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4315  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 69 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0374104  normal  0.166197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3947  cold-shock protein DNA-binding  67.69 
 
 		 69 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2199  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.18 
 
 		 67 aa  97.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0346  cold-shock DNA-binding domain protein  40.12 
 
 		 242 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.631485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2034  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.59 
 
 		 67 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2176  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 69 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141033  normal  0.0176419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3209  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.522557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3257  cold-shock protein, DNA-binding  67.16 
 
 		 69 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 69 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4422  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 		 69 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.369024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0367  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 73 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3436  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 69 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1909  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 		 69 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1185  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 69 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0954  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.71 
 
 		 68 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631034  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1914  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 68 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1556  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 70 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0200  cold-shock DNA-binding domain protein  37.06 
 
 		 311 aa  94  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0333811  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3306  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.5 
 
 		 69 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3878  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 		 69 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3054  cold-shock protein, DNA-binding  69.12 
 
 		 66 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2320  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.680465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4272  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 66 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.217345  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1752  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.64 
 
 		 68 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2262  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.55 
 
 		 242 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 68 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0538  cold-shock DNA-binding domain protein  35 
 
 		 217 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3396  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.65 
 
 		 66 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0003  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 67 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2487  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.87 
 
 		 67 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0454544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3625  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 68 aa  91.7  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164813  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2957  cold-shock DNA-binding domain protein  60.87 
 
 		 67 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.200644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3156  cold-shock DNA-binding domain protein  39.08 
 
 		 268 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>