More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1554 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  100 
 
 		 410 aa  846    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  97.07 
 
 		 410 aa  819    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  94.63 
 
 		 410 aa  780    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  97.07 
 
 		 410 aa  797    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  44.25 
 
 		 580 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  40.3 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.45 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.38 
 
 		 504 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  35.64 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  35.44 
 
 		 5698 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  30.61 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  36.62 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  36.81 
 
 		 513 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  36.5 
 
 		 513 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  31.49 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  36.5 
 
 		 513 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  29.57 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  29.15 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  31.1 
 
 		 345 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 345 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.88 
 
 		 389 aa  163  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  35.85 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  27.44 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  34.57 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  28.57 
 
 		 494 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.21 
 
 		 559 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  25.47 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  24.86 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.87 
 
 		 367 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.78 
 
 		 600 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  28.53 
 
 		 555 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.36 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.78 
 
 		 533 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  29.12 
 
 		 715 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  24.35 
 
 		 675 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.15 
 
 		 470 aa  96.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.15 
 
 		 601 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.06 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.01 
 
 		 497 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.23 
 
 		 669 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.71 
 
 		 616 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.3 
 
 		 498 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.74 
 
 		 635 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  27.03 
 
 		 677 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  23.94 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.69 
 
 		 520 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  23.94 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  23.94 
 
 		 481 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  23.36 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  28.41 
 
 		 778 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  25.55 
 
 		 658 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  22.67 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  26.63 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.64 
 
 		 490 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  23.64 
 
 		 483 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  26.56 
 
 		 695 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.94 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.64 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  27.7 
 
 		 674 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  28.24 
 
 		 661 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.5 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  25.84 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  22.77 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  26.27 
 
 		 633 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.51 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.03 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  26.24 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.52 
 
 		 595 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  25.86 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  25.82 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.96 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  26.25 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.34 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  23.42 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  23.42 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.31 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.86 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.41 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.77 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  28.11 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.58 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.46 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.78 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  23.81 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.26 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  26.86 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  22.93 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  24.86 
 
 		 502 aa  79.7  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.78 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.41 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25.64 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.47 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.79 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.37 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.37 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.37 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.46 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>