More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5093 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  100 
 
 
580 aa  1109    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  95.34 
 
 
592 aa  987    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  49.16 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  39.1 
 
 
534 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  38.91 
 
 
521 aa  302  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  38.5 
 
 
559 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  37.94 
 
 
621 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  35.8 
 
 
627 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  37.37 
 
 
610 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  43.72 
 
 
674 aa  286  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  36.31 
 
 
568 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  38.71 
 
 
1217 aa  281  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  38.61 
 
 
532 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  38.42 
 
 
526 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  38.96 
 
 
918 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  36.61 
 
 
657 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 
899 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  38.56 
 
 
535 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  34.55 
 
 
552 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  33.83 
 
 
1219 aa  233  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  34.01 
 
 
1219 aa  233  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  34.6 
 
 
570 aa  227  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  33.51 
 
 
560 aa  223  7e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  36.72 
 
 
533 aa  223  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  34.07 
 
 
580 aa  223  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  30.31 
 
 
565 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 
552 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  33.54 
 
 
1224 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  32.34 
 
 
1209 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  32.12 
 
 
579 aa  194  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 
715 aa  193  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  32.9 
 
 
1263 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  33.46 
 
 
1184 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  33.9 
 
 
1168 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  33.41 
 
 
1184 aa  187  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  36.3 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  31.62 
 
 
708 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  29.16 
 
 
598 aa  173  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 
614 aa  167  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 
523 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.11 
 
 
521 aa  156  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  27.74 
 
 
575 aa  156  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 
1652 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  31.03 
 
 
569 aa  154  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
526 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.81 
 
 
535 aa  150  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.92 
 
 
521 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  31.09 
 
 
521 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.96 
 
 
519 aa  144  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
522 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  33.83 
 
 
517 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  29.07 
 
 
700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  27.88 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 
539 aa  131  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.48 
 
 
517 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.48 
 
 
517 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 
535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.85 
 
 
535 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  28.86 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 
535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  29.03 
 
 
528 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 
545 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  28.99 
 
 
528 aa  127  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 
521 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 
535 aa  125  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  25.72 
 
 
534 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 
529 aa  123  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  28.46 
 
 
521 aa  123  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 
541 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 
524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 
522 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 
511 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 
511 aa  120  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29.51 
 
 
524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.92 
 
 
516 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 
511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  26.85 
 
 
511 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
511 aa  117  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  26.85 
 
 
511 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 
519 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 
511 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  29.34 
 
 
521 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 
511 aa  117  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 
511 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 
511 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 
511 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.43 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  22.92 
 
 
549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.07 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  25.91 
 
 
537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 
530 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>