More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1171 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  100 
 
 
187 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  85.56 
 
 
187 aa  314  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  60.64 
 
 
193 aa  210  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  59.68 
 
 
193 aa  207  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  60.75 
 
 
189 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  56.15 
 
 
185 aa  201  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  56.99 
 
 
186 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  55.08 
 
 
188 aa  188  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  55.91 
 
 
189 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  56.68 
 
 
185 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  55.14 
 
 
184 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  56.83 
 
 
188 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  55.91 
 
 
198 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  51.65 
 
 
189 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  49.21 
 
 
202 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  50 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  55.32 
 
 
185 aa  148  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  45.99 
 
 
189 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  51.61 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  48.6 
 
 
187 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  49.48 
 
 
202 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  50.61 
 
 
175 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  50.61 
 
 
175 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  52.51 
 
 
186 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  48.39 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  50.92 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  49.73 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  50 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  50.31 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  47.59 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  41.85 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  47.34 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  49.44 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  41.4 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  43.01 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  47.8 
 
 
180 aa  124  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  37.97 
 
 
186 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  44.21 
 
 
191 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  42.93 
 
 
187 aa  121  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  45.95 
 
 
187 aa  121  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  42.78 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  42.47 
 
 
184 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  41.3 
 
 
180 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  42.16 
 
 
185 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  43.72 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.72 
 
 
202 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.11 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.57 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  40.54 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  42.78 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  44.62 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  43.58 
 
 
185 aa  111  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  42.01 
 
 
187 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  45.45 
 
 
184 aa  111  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.58 
 
 
196 aa  111  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  44.62 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  42.7 
 
 
185 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  40 
 
 
197 aa  110  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  38.83 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.96 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.57 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  43.39 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.33 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  36.87 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  40.83 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  40.59 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  36.7 
 
 
188 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  41.03 
 
 
189 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  40.11 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  43.12 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.57 
 
 
191 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.96 
 
 
198 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  32.97 
 
 
183 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  41.18 
 
 
188 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  38.85 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  38.82 
 
 
199 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  39.01 
 
 
189 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  35.54 
 
 
202 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  41.61 
 
 
188 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  39.23 
 
 
192 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  42.86 
 
 
189 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  38.12 
 
 
182 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  38.46 
 
 
193 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40 
 
 
192 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  28.96 
 
 
185 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  39.36 
 
 
185 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  39.36 
 
 
185 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1947  hypothetical protein  41.14 
 
 
206 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  38.95 
 
 
190 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  40.36 
 
 
198 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 
198 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 
198 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 
198 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 
198 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  39.01 
 
 
212 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  34.78 
 
 
207 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  42.21 
 
 
188 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>