More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2456 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  55.28 
 
 		 612 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  56.01 
 
 		 594 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  56.33 
 
 		 626 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  56.31 
 
 		 605 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  59.28 
 
 		 598 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  58.74 
 
 		 561 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  56.4 
 
 		 630 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  54.4 
 
 		 627 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  56.25 
 
 		 614 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  57.6 
 
 		 605 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  56.19 
 
 		 604 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  100 
 
 		 564 aa  1154    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  56.27 
 
 		 633 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  54.17 
 
 		 631 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  54.17 
 
 		 631 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  54.05 
 
 		 581 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  54.71 
 
 		 566 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  53.58 
 
 		 580 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  50.5 
 
 		 619 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  52.28 
 
 		 621 aa  604  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  51.51 
 
 		 605 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  53.94 
 
 		 574 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  50.84 
 
 		 604 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  51.37 
 
 		 589 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  49.75 
 
 		 605 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  50.08 
 
 		 606 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  53.21 
 
 		 606 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  54.61 
 
 		 572 aa  579  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  52.63 
 
 		 592 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  52.76 
 
 		 607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  51.18 
 
 		 659 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  47.68 
 
 		 642 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  50.77 
 
 		 602 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  51.81 
 
 		 568 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  51.62 
 
 		 568 aa  564  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  51.81 
 
 		 568 aa  561  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  50.08 
 
 		 606 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  49.83 
 
 		 606 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  51.37 
 
 		 600 aa  552  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  47.54 
 
 		 664 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  52.36 
 
 		 579 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  46.65 
 
 		 657 aa  545  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  44.92 
 
 		 621 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  43.47 
 
 		 601 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  42.79 
 
 		 601 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  45.32 
 
 		 637 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  45.21 
 
 		 604 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  43.01 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  45.18 
 
 		 590 aa  445  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  43.75 
 
 		 584 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  41.71 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  45.99 
 
 		 563 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  42.43 
 
 		 611 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  43.25 
 
 		 594 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  42.57 
 
 		 593 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  57.68 
 
 		 640 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  43.58 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  52.91 
 
 		 652 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  52.91 
 
 		 652 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  52.91 
 
 		 671 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  52.32 
 
 		 669 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  51.46 
 
 		 656 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  39.74 
 
 		 599 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  52.76 
 
 		 672 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  51.32 
 
 		 664 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  50.51 
 
 		 666 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  47.58 
 
 		 638 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  37.33 
 
 		 803 aa  325  2e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  42.76 
 
 		 673 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  47.03 
 
 		 630 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  47.66 
 
 		 680 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  32.47 
 
 		 809 aa  269  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  32.68 
 
 		 705 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  31.38 
 
 		 871 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  31.89 
 
 		 746 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  40.92 
 
 		 1064 aa  246  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  33.42 
 
 		 946 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  30.54 
 
 		 518 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  30.32 
 
 		 521 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  30.34 
 
 		 518 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  30.64 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  33.83 
 
 		 941 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  27.84 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  27.84 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  30 
 
 		 565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  27.13 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  31.05 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  30.38 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.85 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  26.74 
 
 		 546 aa  180  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  26.78 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  26.78 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.06 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  30 
 
 		 521 aa  177  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  27.89 
 
 		 508 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  26.59 
 
 		 551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  32.78 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  27.43 
 
 		 498 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  33.75 
 
 		 506 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  35.06 
 
 		 489 aa  133  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>