More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0526 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  69.76 
 
 
211 aa  301  5.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  59.31 
 
 
211 aa  247  9e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  50.72 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  54.04 
 
 
213 aa  215  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  53.27 
 
 
210 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  49.76 
 
 
208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  49.76 
 
 
208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  49.76 
 
 
208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  49.76 
 
 
208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  49.76 
 
 
208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  49.76 
 
 
208 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  49.76 
 
 
208 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  52.91 
 
 
214 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  50.72 
 
 
208 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  47.85 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  48.31 
 
 
217 aa  195  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  47.55 
 
 
203 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  47.06 
 
 
205 aa  185  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  47.06 
 
 
205 aa  185  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  50.75 
 
 
213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.77 
 
 
219 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  47.52 
 
 
216 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  43.69 
 
 
209 aa  177  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.95 
 
 
206 aa  174  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  45.67 
 
 
218 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.96 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  43.96 
 
 
210 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.15 
 
 
210 aa  168  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  46.39 
 
 
210 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.66 
 
 
213 aa  167  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.15 
 
 
210 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  45.77 
 
 
213 aa  167  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.29 
 
 
212 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.88 
 
 
210 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.08 
 
 
217 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.5 
 
 
207 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45.19 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  42.66 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  45.37 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.02 
 
 
210 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  46.73 
 
 
214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.78 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  43 
 
 
705 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.29 
 
 
703 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  42.56 
 
 
671 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  45.6 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.13 
 
 
212 aa  161  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40.7 
 
 
219 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.35 
 
 
203 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.55 
 
 
216 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  43.78 
 
 
211 aa  157  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.6 
 
 
205 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  40.28 
 
 
226 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  42.11 
 
 
213 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  42.86 
 
 
686 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  43 
 
 
203 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  45.18 
 
 
211 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  44.85 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  42.93 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.55 
 
 
221 aa  154  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  45.36 
 
 
210 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  42.52 
 
 
213 aa  154  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.55 
 
 
229 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.08 
 
 
686 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  42.65 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  41.46 
 
 
204 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  41.35 
 
 
206 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  41.55 
 
 
214 aa  151  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.41 
 
 
222 aa  151  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.93 
 
 
207 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.41 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  40.67 
 
 
209 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  44.1 
 
 
205 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  40.87 
 
 
206 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  40 
 
 
224 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  42 
 
 
206 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  39.32 
 
 
203 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  39.44 
 
 
215 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  43.72 
 
 
202 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  47.4 
 
 
225 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  39.81 
 
 
225 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  40.48 
 
 
206 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  41.59 
 
 
234 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  40 
 
 
217 aa  148  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  40 
 
 
217 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.56 
 
 
901 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  44.44 
 
 
213 aa  148  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.16 
 
 
208 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  43.94 
 
 
243 aa  147  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  41.5 
 
 
206 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  41.5 
 
 
206 aa  147  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  42.18 
 
 
206 aa  147  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  40.48 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  43 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  41 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  44.51 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>