108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0233 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0154  adc operon repressor AdcR  57.53 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2420  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2018  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000120097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1290  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000103671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0099  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.36846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  28.71 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  23.15 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 165 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 141 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 171 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  23.68 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2081  transcriptional regulator, TrmB  29.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  23.47 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>