More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1829 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  48.46 
 
 
299 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  49.6 
 
 
254 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  46.26 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  45.77 
 
 
302 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  44.88 
 
 
282 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  47.35 
 
 
291 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  47.35 
 
 
291 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  47.35 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  43.78 
 
 
266 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  42.57 
 
 
250 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  47.13 
 
 
291 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  46.12 
 
 
291 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  39.51 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  46.12 
 
 
291 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  44.93 
 
 
303 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  47.08 
 
 
265 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  48.64 
 
 
257 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  46.52 
 
 
252 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  47.06 
 
 
301 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  46.67 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  41.03 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  35.12 
 
 
266 aa  125  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  35.56 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  35.39 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  37.92 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  43.25 
 
 
255 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  36.52 
 
 
256 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  46.26 
 
 
267 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  32.97 
 
 
266 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  41.77 
 
 
292 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 
271 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  36.13 
 
 
277 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.85 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  44.65 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  42.27 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  32.71 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  32.77 
 
 
267 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  43.27 
 
 
296 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  33.86 
 
 
268 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  28.87 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  36.59 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  35.2 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  29.76 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  35.38 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  33.51 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  31.91 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  32.24 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  32.65 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  37.25 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  38.62 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  34.48 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  34.48 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  34.84 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  37.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  37.69 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  37.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  37.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  41.55 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  36.05 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  33.2 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  38.1 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  31.6 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  30.43 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  30.31 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  30.17 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  38.27 
 
 
267 aa  72  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  36.02 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  30.83 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  30.83 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  32.88 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  32.55 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  30.83 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  29.05 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  34.15 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.05 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  34.35 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  27.73 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  33.62 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  32.42 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  30.38 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  37.33 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  32.65 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  24.83 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0945  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000136612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  30.41 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  32.8 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>