71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0140 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  100 
 
 		 375 aa  770    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  49.17 
 
 		 362 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  49.83 
 
 		 294 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  36.47 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  36.2 
 
 		 367 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  35.88 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  36.81 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  33.73 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  31.4 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  35.65 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  39.44 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  33.53 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  35.45 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  33.54 
 
 		 385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  31.44 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  31.25 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  30.61 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  28.69 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  27.6 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  30.99 
 
 		 250 aa  96.7  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 335 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  27.96 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27.21 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  26.63 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.15 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  24.57 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  22.42 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  29.05 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  24.57 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  27.45 
 
 		 164 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.63 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  27.74 
 
 		 197 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  31.48 
 
 		 125 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  23.29 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.8 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  22.07 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  24.64 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  29.79 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  25.6 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  32.53 
 
 		 101 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.97 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.97 
 
 		 376 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.97 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  27.46 
 
 		 638 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  25.11 
 
 		 281 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.64 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.79 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  22.65 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.93 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  21.47 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  25.27 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.48 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  25.27 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  25.5 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.37 
 
 		 353 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6639  phage integrase family site specific recombinase  27.91 
 
 		 257 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.78 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.21 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  27.1 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  25.24 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>