285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1996 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  63.64 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  62.56 
 
 		 267 aa  284  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  62.56 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  65.87 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  62.44 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  64.42 
 
 		 262 aa  274  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  61.97 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  61.97 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  62.62 
 
 		 246 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  62.15 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  57.87 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  62.44 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  63.43 
 
 		 239 aa  267  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  62.62 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  58.33 
 
 		 243 aa  265  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  64.59 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  58.18 
 
 		 262 aa  261  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  59.09 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  61.68 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  58.45 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  62.09 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  61.03 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  61.76 
 
 		 217 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  59.26 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  60.56 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  62.38 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  59.81 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  62.91 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  61.82 
 
 		 247 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  63.26 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  59.72 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  61.14 
 
 		 240 aa  248  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  58.88 
 
 		 223 aa  245  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  61.14 
 
 		 245 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  60.75 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  62.84 
 
 		 211 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  60.19 
 
 		 231 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  66.1 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  57.41 
 
 		 222 aa  238  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  54.21 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  47.57 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  48.29 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  46.38 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  46.63 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  42.05 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  37.02 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  40 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.88 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  38.81 
 
 		 227 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  37.93 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 252 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 249 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 249 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 249 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  40.96 
 
 		 246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  39.11 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  41.85 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  44.19 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  41.01 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  44.83 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  43.18 
 
 		 239 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  42.54 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  44.13 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  43.45 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  40.66 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  41.81 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  41.03 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  43.01 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.97 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  38.97 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  38.65 
 
 		 233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  41.94 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  44.77 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  46.7 
 
 		 383 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  44.09 
 
 		 246 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  44.2 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  44.79 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  43.35 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  40.88 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  41.06 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  42.93 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  49.69 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  40.5 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  42.37 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>