202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3237 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3237  VacJ family lipoprotein  100 
 
 		 267 aa  544  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2890  VacJ family lipoprotein  97.75 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194076  normal  0.292718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2959  lipoprotein precursor (VACJ) transmembrane  84.76 
 
 		 269 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3119  VacJ-like lipoprotein  66.67 
 
 		 303 aa  331  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.351213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3256  VacJ-like lipoprotein  64.59 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4906  VacJ-like lipoprotein  59.91 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0796  VacJ-like lipoprotein  59.51 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0889982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0688  VacJ family lipoprotein  57.89 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2938  VacJ-like lipoprotein  54.2 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0390  putative transmembrane lipoprotein, VacJ  52.59 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2767  VacJ family lipoprotein  52.16 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0014  putative VacJ-like lipoprotein  57.34 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7032  VacJ family lipoprotein  58.26 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0355666  hitchhiker  0.0000000126773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4134  VacJ family lipoprotein  53.12 
 
 		 336 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3568  VacJ family lipoprotein  51.52 
 
 		 340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0155461  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1157  VacJ family lipoprotein  55.51 
 
 		 248 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3183  VacJ family lipoprotein  51.79 
 
 		 337 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.096737  normal  0.0774844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1016  VacJ family lipoprotein  53.33 
 
 		 260 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4165  lipoprotein vacJ precursor  53.42 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0021  VacJ-like lipoprotein  52.51 
 
 		 329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4949  VacJ family lipoprotein  51.58 
 
 		 334 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0509972 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0751  VacJ family lipoprotein  54.42 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2351  lipoprotein VacJ  48.81 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4558  VacJ family lipoprotein  51.13 
 
 		 347 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0719  VacJ family lipoprotein  54.67 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1481  lipoprotein VacJ  52.68 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3265  putative lipoprotein  51.98 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3152  putative lipoprotein  51.98 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5502  VacJ family lipoprotein  51.13 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0790497  normal  0.0344756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5182  VacJ-like lipoprotein  51.13 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5677  VacJ family lipoprotein  51.13 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205363 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3674  VacJ family lipoprotein  52.77 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359554  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2092  putative lipoprotein  52 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0340825  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3701  lipoprotein VacJ  52.77 
 
 		 319 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3001  lipoprotein VacJ  53.3 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2384  putative lipoprotein  52.7 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1120  putative lipoprotein  52 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1400  putative lipoprotein  52.7 
 
 		 327 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3732  VacJ family lipoprotein  52.77 
 
 		 336 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3231  lipoprotein VacJ  51.91 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.302399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2723  lipoprotein VacJ  51.91 
 
 		 319 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2773  lipoprotein VacJ  51.91 
 
 		 319 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1780  lipoprotein VacJ  51.91 
 
 		 319 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5533  VacJ family lipoprotein  52.59 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2690  VacJ-like lipoprotein  54.37 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0417  VacJ family lipoprotein  54.37 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0396  VacJ family lipoprotein  54.37 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0320  VacJ family lipoprotein  54.37 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0114383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2400  VacJ family lipoprotein  52.21 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.82421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0335  VacJ family lipoprotein  53.88 
 
 		 321 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0344  VacJ family lipoprotein  53.88 
 
 		 321 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616995  normal  0.360268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3515  VacJ-like lipoprotein  53.4 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370194  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3391  VacJ family lipoprotein  48.13 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0099  VacJ family lipoprotein  50.65 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0098  VacJ family lipoprotein  51.1 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000010266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3399  VacJ-like lipoprotein  49.78 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2450  Surface lipoprotein-like protein  50.45 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1035  VacJ-like lipoprotein  47.73 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2787  VacJ-like lipoprotein  46.7 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0585  VacJ-like lipoprotein  47.27 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000197626  normal  0.0896852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0891  VacJ family lipoprotein  48.03 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1471  VacJ-like lipoprotein  46.46 
 
 		 249 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3098  putative lipoprotein  48.42 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.633351  normal  0.297241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1110  surface lipoprotein-like  45.68 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1704  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 		 235 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2076  vacJ lipoprotein  43.15 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2518  VacJ family lipoprotein  45.76 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1680  VacJ family lipoprotein  44.78 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3579  VacJ family lipoprotein  43.91 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0357  VacJ family lipoprotein  45.76 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2163  VacJ family lipoprotein  47.52 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0344293  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2357  hypothetical protein  43.64 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27920  hypothetical protein  43.22 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2115  vacJ lipoprotein, putative  42.02 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0452943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1910  VacJ-like lipoprotein  41.6 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429017  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2557  VacJ-like lipoprotein  40.09 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1810  hypothetical protein  42.01 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1809  hypothetical protein  41.55 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3850  VacJ-like lipoprotein  42.86 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1589  VacJ family lipoprotein  45.37 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1927  VacJ family lipoprotein  46.6 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20570  VacJ-like lipoprotein  43.2 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0305  VacJ family lipoprotein  43.08 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1772  VacJ family lipoprotein  38.84 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.872962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4021  VacJ family lipoprotein  41.28 
 
 		 336 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2113  vacJ lipoprotein  38.84 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32730  VacJ-like lipoprotein  40.17 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0586  S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase MraW  42.93 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0676  VacJ-like lipoprotein  41.26 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.325584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2403  VacJ family lipoprotein  44.06 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.875073  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03206  lipoprotein  40.69 
 
 		 352 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2202  ABC transporter ATPase  41.03 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0450  VacJ lipoprotein  47.69 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.48332e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1753  VacJ family lipoprotein  40.85 
 
 		 350 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1821  lipoprotein precursor  40.85 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1737  VacJ family lipoprotein  47.02 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.577648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0319  VacJ family lipoprotein  41.84 
 
 		 230 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3982  VacJ family lipoprotein  46.43 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0949858  normal  0.740896 
 
 
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NC_010581  Bind_2594  VacJ family lipoprotein  39.05 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.123162  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3760  VacJ-like lipoprotein  46.67 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.364095  normal  0.111651 
 
 
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