More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4153 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  71.43 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  62.42 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  62.42 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  62.33 
 
 		 149 aa  190  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 149 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 149 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 149 aa  190  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  61.54 
 
 		 166 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  60.4 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  62.76 
 
 		 150 aa  186  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  58.27 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 151 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  53.69 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  53.69 
 
 		 154 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  53.69 
 
 		 154 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  53.69 
 
 		 154 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  53.69 
 
 		 244 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  53.69 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  55.63 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  53.02 
 
 		 268 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  54.93 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 152 aa  150  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  52.41 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  41.56 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  50.75 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  42.66 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  37.97 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  42.65 
 
 		 193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  43.8 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 209 aa  111  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 168 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  47.62 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  40.13 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 177 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.77 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  34.06 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  38.41 
 
 		 188 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 290 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 171 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  41.01 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  46.6 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  38.67 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  41.9 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  38.03 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 280 aa  87.8  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 168 aa  87.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  38.21 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  35.66 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  40.8 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 147 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  37.61 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>