More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3813 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2122  ATPase  71.76 
 
 		 673 aa  903    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.91 
 
 		 673 aa  906    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 674 aa  1347    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  45.38 
 
 		 497 aa  297  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  43.51 
 
 		 528 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.75 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  41.14 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.95 
 
 		 225 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  39.1 
 
 		 601 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  35.89 
 
 		 491 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  37.7 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  37.55 
 
 		 551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  37.38 
 
 		 552 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  39.35 
 
 		 407 aa  97.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  34.8 
 
 		 336 aa  94.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 		 406 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 		 406 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  33.68 
 
 		 439 aa  89.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  30.88 
 
 		 326 aa  87.8  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  33.16 
 
 		 814 aa  88.2  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  35.76 
 
 		 393 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  31.02 
 
 		 800 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  32.09 
 
 		 800 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  29 
 
 		 882 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  35 
 
 		 932 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  33.73 
 
 		 827 aa  84.7  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  36.69 
 
 		 805 aa  84.7  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  30.91 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  30.91 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  32.57 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  30.91 
 
 		 326 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  30.77 
 
 		 326 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 		 793 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  30.87 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  34.3 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 816 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  33.81 
 
 		 819 aa  82.4  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 798 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  30.33 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  29.08 
 
 		 792 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  27.44 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  35 
 
 		 815 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 805 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 1309 aa  80.9  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 825 aa  81.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 805 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 808 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  30.45 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 805 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  33.81 
 
 		 853 aa  80.9  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  29.08 
 
 		 791 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  29.08 
 
 		 791 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  32.89 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  32.64 
 
 		 835 aa  80.5  0.00000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 807 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  34.75 
 
 		 807 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 796 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  32.02 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  29.68 
 
 		 326 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  35.46 
 
 		 799 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  35.46 
 
 		 799 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 812 aa  79.7  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  31.71 
 
 		 800 aa  79  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  35.97 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 800 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  35.97 
 
 		 785 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 825 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 		 780 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  32.32 
 
 		 793 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  33.09 
 
 		 803 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  30.96 
 
 		 776 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  30.26 
 
 		 803 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  27.71 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  26.56 
 
 		 791 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  31.54 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.77 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.41 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  27.71 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  27.71 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  30.43 
 
 		 810 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  30.41 
 
 		 773 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 854 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  28.95 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 813 aa  77.8  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  31.13 
 
 		 856 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  32.52 
 
 		 776 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  31.54 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>