122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3286 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  893    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  33.88 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  32.29 
 
 		 419 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  32.07 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  32.88 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  32.23 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  29.65 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  28.07 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.36 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  23.45 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.9 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  32.42 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.56 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  29.28 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  24.18 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  22.71 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  22.71 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  22.96 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  26.76 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.27 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  24.83 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  27.05 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  19.57 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  22.4 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  22.4 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  22.33 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  22.19 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  28.64 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  24.42 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  30.39 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  21.35 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  30.16 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.41 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  32.79 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  24.03 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  19.76 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  27.06 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  25.2 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  20.47 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  33.55 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  30.95 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  23.64 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0586  hypothetical protein  27.9 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  27.46 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  26.02 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3365  hypothetical protein  21.33 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  31.58 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  25.31 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  28.47 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  21.97 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  29.66 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  31.55 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  30.58 
 
 		 552 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  27.61 
 
 		 291 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  20.29 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  27.22 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  31.2 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.08 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  24.56 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  28.79 
 
 		 290 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  26.25 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  30.89 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  30.53 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  29.44 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  23.17 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  24.8 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.39 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  22.87 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  28.17 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  31.76 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  27.12 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  26.67 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1324  hypothetical protein  24.58 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  24.82 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  24.39 
 
 		 384 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  24.68 
 
 		 323 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0254  hypothetical protein  21.39 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  25.7 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  21.71 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  26.4 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  28.15 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  30.37 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  29.91 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  37.04 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  21.78 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.07 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  26.79 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  24.03 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  27.59 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 575 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  25 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  25.89 
 
 		 380 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.94 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  25.83 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.1 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  28.48 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>