85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1076 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  60 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  43.51 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  43.38 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  42.54 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  47.69 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  41.48 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  40.62 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  39.23 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.15 
 
 		 131 aa  96.7  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  45.74 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  39.06 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  38.64 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  39.53 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  38.93 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  40.83 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.06 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  37.9 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  36.72 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  29.85 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  36.97 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  35.66 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.61 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  31.01 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  32.06 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  43.14 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  32.58 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  30.77 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  27.42 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  27.42 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  26.72 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  36.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  27.01 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  40.74 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  47.37 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  35.59 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  39.24 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  26.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  28.26 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  26.92 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  27.68 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  41.86 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  37.33 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  36.73 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  30.3 
 
 		 98 aa  42  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  38.3 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  40.74 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  32.08 
 
 		 86 aa  40.8  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  25.95 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  42.55 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  21.15 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  31.48 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  29.09 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  29.09 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>