299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1934 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  100 
 
 
266 aa  551  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  66.8 
 
 
273 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  65 
 
 
262 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  65 
 
 
262 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  60.08 
 
 
265 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  61.39 
 
 
269 aa  347  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  61.35 
 
 
260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  61.85 
 
 
260 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  59.77 
 
 
271 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  61.45 
 
 
260 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  59.45 
 
 
259 aa  332  4e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  61.04 
 
 
260 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  59.45 
 
 
259 aa  332  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  61.33 
 
 
272 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  60.24 
 
 
260 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  59.22 
 
 
260 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  59.04 
 
 
260 aa  326  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  56.92 
 
 
256 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  58.82 
 
 
265 aa  318  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  55.98 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  56.92 
 
 
275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  57.2 
 
 
269 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  54.69 
 
 
261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  56.7 
 
 
293 aa  308  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  54.41 
 
 
278 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  57.31 
 
 
256 aa  308  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  53.58 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  56.92 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  56.25 
 
 
271 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  57.09 
 
 
256 aa  302  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  55 
 
 
275 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  54.41 
 
 
275 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  56.42 
 
 
274 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  55.08 
 
 
271 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  55.08 
 
 
271 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  53.54 
 
 
267 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  53.52 
 
 
272 aa  295  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  54.44 
 
 
277 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  292  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  53.04 
 
 
257 aa  291  8e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  56.25 
 
 
280 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  55.08 
 
 
279 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  56.13 
 
 
258 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  56.8 
 
 
256 aa  285  7e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  54.65 
 
 
273 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  56 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  56.4 
 
 
264 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  55.86 
 
 
270 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  55.21 
 
 
270 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  54.25 
 
 
254 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  54.62 
 
 
257 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  53.04 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  46.72 
 
 
272 aa  235  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  45.88 
 
 
259 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  47.83 
 
 
269 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  46.22 
 
 
260 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  44.44 
 
 
256 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  46.43 
 
 
260 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  46.61 
 
 
260 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  47.24 
 
 
273 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  47.24 
 
 
273 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  46.59 
 
 
258 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  46.43 
 
 
257 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  46.43 
 
 
257 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  46.43 
 
 
257 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  46.64 
 
 
291 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  46.34 
 
 
266 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  45.82 
 
 
260 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  46.4 
 
 
252 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  45.02 
 
 
259 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  44.84 
 
 
263 aa  220  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2500  thiazole synthase  46.59 
 
 
276 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000745865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  46.59 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  44.71 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.48 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  45.97 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  45.88 
 
 
267 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  44.84 
 
 
257 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0034  thiazole synthase  45.95 
 
 
262 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2779  thiazole synthase  46.34 
 
 
273 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  44.98 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  48.21 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  45.06 
 
 
281 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  48.4 
 
 
265 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  43.25 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.7 
 
 
326 aa  215  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>