299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1956 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  100 
 
 
260 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  94.62 
 
 
260 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  93.85 
 
 
260 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  86.92 
 
 
260 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  84.23 
 
 
260 aa  454  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  84.62 
 
 
260 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  86.15 
 
 
260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  67.84 
 
 
256 aa  353  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  66.93 
 
 
265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  62.7 
 
 
257 aa  334  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  63.35 
 
 
267 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  65.06 
 
 
256 aa  332  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  61.04 
 
 
266 aa  332  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  58.96 
 
 
273 aa  331  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  66.53 
 
 
258 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  64.68 
 
 
254 aa  324  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  65.1 
 
 
256 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  64.71 
 
 
256 aa  321  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  60.78 
 
 
269 aa  319  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  57.42 
 
 
269 aa  318  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  60.08 
 
 
259 aa  314  7e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  58.14 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  59.68 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  63.49 
 
 
257 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  58.14 
 
 
275 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  53.46 
 
 
262 aa  310  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  57.36 
 
 
275 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  53.46 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  56.32 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  56.81 
 
 
278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  54.23 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  56.64 
 
 
271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  56.64 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  64.29 
 
 
257 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  56.64 
 
 
271 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  61.9 
 
 
264 aa  300  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  59.61 
 
 
271 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  55 
 
 
261 aa  300  1e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  56.64 
 
 
271 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  59.61 
 
 
256 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  55.86 
 
 
274 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  53.08 
 
 
265 aa  299  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  56.25 
 
 
271 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  56.25 
 
 
271 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  63.89 
 
 
257 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  58.04 
 
 
280 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  52.94 
 
 
272 aa  294  8e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  56.92 
 
 
293 aa  291  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  57.2 
 
 
273 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  56.86 
 
 
277 aa  288  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  54.8 
 
 
271 aa  287  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  54.86 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  56.57 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  56.47 
 
 
270 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  56.47 
 
 
270 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  48.85 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  49.39 
 
 
272 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  46 
 
 
255 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  45.2 
 
 
255 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
269 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  49.59 
 
 
273 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  46.61 
 
 
259 aa  221  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  49.59 
 
 
273 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  50.41 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  44.44 
 
 
260 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  51.23 
 
 
265 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  50.82 
 
 
265 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  44.36 
 
 
261 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  49.6 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  47.43 
 
 
258 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  47.84 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  44.62 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  46.15 
 
 
255 aa  211  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  43.6 
 
 
256 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  48.03 
 
 
291 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  48 
 
 
265 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  45.2 
 
 
271 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  45.2 
 
 
271 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  45.2 
 
 
271 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  44.84 
 
 
271 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  48.37 
 
 
256 aa  208  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  45.1 
 
 
254 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  45.42 
 
 
259 aa  206  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  47.56 
 
 
256 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  44.71 
 
 
254 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  44.71 
 
 
254 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  44.71 
 
 
254 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  44.71 
 
 
254 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  44.31 
 
 
267 aa  204  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>