299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0109 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  100 
 
 		 275 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  93.82 
 
 		 275 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  94.55 
 
 		 275 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  73.82 
 
 		 278 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  73.19 
 
 		 282 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  70 
 
 		 272 aa  384  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  72.18 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  68 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  69.4 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  70.41 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  69.66 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  69.23 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  69.03 
 
 		 271 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  70.04 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  69.23 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  70.04 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  69.29 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  69.29 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  69.29 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  68.5 
 
 		 271 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  68.38 
 
 		 271 aa  370  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  69.29 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  69.29 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  69.29 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  69.29 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  70.11 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  70.04 
 
 		 271 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  70.22 
 
 		 279 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  71.81 
 
 		 270 aa  348  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  69.65 
 
 		 280 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  70.34 
 
 		 270 aa  345  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  61.89 
 
 		 269 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  63.6 
 
 		 271 aa  328  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  64.64 
 
 		 272 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  61.63 
 
 		 260 aa  325  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  60.94 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  60.08 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  58.91 
 
 		 260 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  60.85 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  62.8 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  60.31 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  57.54 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  56.92 
 
 		 266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  58.14 
 
 		 260 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  59.76 
 
 		 260 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  59.53 
 
 		 267 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  58.82 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  59.27 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  55.13 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  60.87 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  58.87 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  63.24 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  53.94 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  58.62 
 
 		 277 aa  288  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  53.57 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  58.43 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  57.14 
 
 		 293 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  58.04 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  58.2 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  53.17 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  49.42 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  60.32 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  49.04 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  56.92 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  60 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  58.73 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  50.76 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  51.18 
 
 		 272 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  52.23 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  51.37 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  52.65 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  50.39 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  50.19 
 
 		 266 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  45.88 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  50.58 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  45.88 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  49 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  44.23 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  43.77 
 
 		 260 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  47.67 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  49.4 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  47.22 
 
 		 296 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  44.09 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  47.45 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  47.17 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  48.63 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  47.56 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34630  thiazole-phosphate synthase  50.2 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.087197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  44.15 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  45.34 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 262 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  48.41 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3503  thiazole biosynthesis family protein  44.36 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  46.25 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  46.25 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  43.4 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  44.66 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  46.51 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  44.66 
 
 		 256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>