More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0253 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  100 
 
 
265 aa  547  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  61.36 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  62.84 
 
 
269 aa  349  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  60.08 
 
 
266 aa  348  7e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  60 
 
 
262 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  59.23 
 
 
262 aa  339  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  54.75 
 
 
271 aa  308  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  58.11 
 
 
269 aa  309  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  54.37 
 
 
271 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  54.75 
 
 
271 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  54.37 
 
 
271 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  54.37 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  54.37 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  54.37 
 
 
271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  54.62 
 
 
260 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  54.62 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  53.99 
 
 
274 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  52.85 
 
 
272 aa  301  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  52.69 
 
 
260 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  53.05 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  53.08 
 
 
260 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  54.23 
 
 
260 aa  300  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  53.05 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  53.05 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  53.05 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  53.05 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  53.05 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  53.05 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  55.13 
 
 
275 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  56.42 
 
 
277 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  55.94 
 
 
275 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  53.44 
 
 
271 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  53.08 
 
 
260 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  53.67 
 
 
260 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  55.56 
 
 
275 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  53.28 
 
 
261 aa  297  1e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  54.23 
 
 
278 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  57.79 
 
 
271 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  52.73 
 
 
259 aa  294  9e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  52.73 
 
 
259 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  55.73 
 
 
280 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  51.15 
 
 
261 aa  293  3e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  52.12 
 
 
271 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  52.85 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  52.85 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  51.89 
 
 
282 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  56.11 
 
 
279 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  52.51 
 
 
272 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  52.71 
 
 
256 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  53.78 
 
 
267 aa  285  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  52.92 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  54.17 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  56.27 
 
 
270 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
265 aa  279  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  56.27 
 
 
270 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  50 
 
 
257 aa  275  6e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  51.19 
 
 
256 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  50 
 
 
256 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  52.73 
 
 
264 aa  262  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  49.61 
 
 
256 aa  261  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  50.4 
 
 
254 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  51.57 
 
 
258 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  48.82 
 
 
257 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  48.25 
 
 
256 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
272 aa  246  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  48.44 
 
 
269 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  48.25 
 
 
273 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  47.06 
 
 
267 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  48.25 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  48.66 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  47.62 
 
 
272 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  49.02 
 
 
265 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  49.02 
 
 
265 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  47.64 
 
 
257 aa  231  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  45.28 
 
 
252 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  48.62 
 
 
255 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  44.49 
 
 
258 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  47.81 
 
 
281 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  47.27 
 
 
259 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  45.63 
 
 
266 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2500  thiazole synthase  47.22 
 
 
276 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000745865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  48.11 
 
 
265 aa  224  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  47.22 
 
 
257 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2779  thiazole synthase  46.03 
 
 
273 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  45.35 
 
 
296 aa  222  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0613  thiazole synthase  47.22 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  46.43 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  46.85 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  46.43 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  44.84 
 
 
252 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  46.61 
 
 
254 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  42.8 
 
 
259 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  44.7 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  45.88 
 
 
257 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  44.02 
 
 
263 aa  214  8e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  46.18 
 
 
265 aa  215  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  43.7 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  41.5 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  40.94 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  44.4 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>