299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4094 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  94.62 
 
 
260 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  94.62 
 
 
260 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  86.92 
 
 
260 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  84.23 
 
 
260 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  86.15 
 
 
260 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  83.46 
 
 
260 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  67.45 
 
 
256 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  66.54 
 
 
265 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  62.3 
 
 
257 aa  333  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  63.35 
 
 
267 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  61.45 
 
 
266 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  58.17 
 
 
273 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  64.26 
 
 
256 aa  329  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  64.31 
 
 
256 aa  323  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  63.92 
 
 
256 aa  322  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  64.29 
 
 
254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  64.11 
 
 
258 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  58.91 
 
 
275 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  58.53 
 
 
275 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  57.42 
 
 
269 aa  318  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  60.08 
 
 
259 aa  316  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  59.22 
 
 
269 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  57.75 
 
 
275 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  59.68 
 
 
259 aa  314  7e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  63.49 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  53.85 
 
 
262 aa  310  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  55.94 
 
 
282 aa  309  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  53.85 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  56.81 
 
 
278 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  59.22 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  54.62 
 
 
261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  56.25 
 
 
271 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  63.89 
 
 
257 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  56.25 
 
 
271 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  55.86 
 
 
271 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  53.08 
 
 
265 aa  300  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  55.38 
 
 
261 aa  300  1e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  55.08 
 
 
274 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  55.47 
 
 
271 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  52.94 
 
 
272 aa  298  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  55.08 
 
 
271 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  55.08 
 
 
271 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  54.69 
 
 
271 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  59.22 
 
 
256 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  60.71 
 
 
264 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  53.91 
 
 
271 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  57.65 
 
 
280 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  62.7 
 
 
257 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  56.81 
 
 
273 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  56.8 
 
 
293 aa  289  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  54.86 
 
 
279 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  55.64 
 
 
277 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  54.03 
 
 
271 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  55.29 
 
 
270 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  55.29 
 
 
270 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  55.42 
 
 
272 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  48.98 
 
 
272 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  45.2 
 
 
255 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  47.31 
 
 
259 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
273 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
273 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  44.4 
 
 
255 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  49.21 
 
 
291 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  49.59 
 
 
269 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  49.59 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  51.24 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  45.82 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  51.24 
 
 
265 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  48.81 
 
 
265 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  48.78 
 
 
256 aa  215  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  46.25 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  42.86 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  45.93 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  46.55 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  42.8 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  43.85 
 
 
256 aa  211  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  47.2 
 
 
265 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  44.05 
 
 
271 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  44.4 
 
 
271 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  44.4 
 
 
271 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  44.4 
 
 
271 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  44.94 
 
 
255 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  43.37 
 
 
263 aa  208  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  47.76 
 
 
256 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  45.02 
 
 
259 aa  207  1e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  42 
 
 
256 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  43.9 
 
 
267 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  44.72 
 
 
256 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  47.97 
 
 
256 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  46.77 
 
 
262 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>