299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0912 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  76.08 
 
 
256 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  75.79 
 
 
254 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  74.41 
 
 
256 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  71.15 
 
 
256 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  70.2 
 
 
265 aa  359  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  69.26 
 
 
267 aa  354  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  69.96 
 
 
256 aa  350  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  69.57 
 
 
256 aa  349  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  67.19 
 
 
258 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  58.24 
 
 
273 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  64.03 
 
 
275 aa  317  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  66.14 
 
 
257 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  63.24 
 
 
275 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  62.3 
 
 
260 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  62.3 
 
 
260 aa  314  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  62.3 
 
 
260 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  62.3 
 
 
260 aa  311  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  61.9 
 
 
260 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  63.24 
 
 
275 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  60.71 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  66.14 
 
 
257 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  66.14 
 
 
257 aa  305  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  61.11 
 
 
260 aa  304  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  56.47 
 
 
257 aa  301  5.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  59.09 
 
 
269 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  58.14 
 
 
282 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  58.66 
 
 
278 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  58.43 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  58.73 
 
 
274 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  55.6 
 
 
259 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  55.6 
 
 
259 aa  290  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  57.94 
 
 
271 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  56.4 
 
 
266 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  57.54 
 
 
271 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  57.54 
 
 
271 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  57.54 
 
 
271 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  57.54 
 
 
271 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  57.54 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  54.15 
 
 
272 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  57.65 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  57.63 
 
 
271 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  56.34 
 
 
277 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  57.94 
 
 
271 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  53.99 
 
 
269 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  56.75 
 
 
271 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  56.7 
 
 
270 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  55.85 
 
 
273 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  54 
 
 
262 aa  275  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  56.7 
 
 
270 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  57.31 
 
 
293 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  53.2 
 
 
262 aa  274  9e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  52.73 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  56.92 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  57.47 
 
 
279 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  56.39 
 
 
271 aa  271  9e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  57.2 
 
 
272 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  56.8 
 
 
271 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  51.59 
 
 
261 aa  265  8e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  50 
 
 
261 aa  256  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  53.66 
 
 
265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  52.42 
 
 
256 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  50.41 
 
 
269 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  53.23 
 
 
265 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  50.41 
 
 
267 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
273 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
273 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  49.19 
 
 
291 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  45.98 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  46.47 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  50.6 
 
 
281 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  46.34 
 
 
256 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  49.2 
 
 
254 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01720  thiazole-phosphate synthase  50.6 
 
 
268 aa  208  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  47.2 
 
 
296 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2500  thiazole synthase  48.79 
 
 
276 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000745865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  44.94 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  47.76 
 
 
272 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  48.16 
 
 
263 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  49 
 
 
256 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1284  thiazole biosynthesis protein ThiG  45.7 
 
 
270 aa  202  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2779  thiazole synthase  48.79 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  49 
 
 
276 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  43.72 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  43.72 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  47.06 
 
 
260 aa  198  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  50.66 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  43.32 
 
 
260 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  46.72 
 
 
257 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  47.56 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  42.86 
 
 
259 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  44.32 
 
 
266 aa  194  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  45.31 
 
 
259 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>