More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1284 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1284  thiazole biosynthesis protein ThiG  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  62.6 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2779  thiazole synthase  60 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2500  thiazole synthase  61.2 
 
 		 276 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000745865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  55.73 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34630  thiazole-phosphate synthase  59.6 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.087197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  58.5 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  58 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  57.48 
 
 		 256 aa  278  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  57.25 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  57.09 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  56.47 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  56.08 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0710  thiazole synthase  57.14 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.528279  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  54.86 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0537  thiazole synthase  60.98 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0547  thiazole synthase  60.98 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0559  thiazole synthase  60.98 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  55.94 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  55.04 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  59.62 
 
 		 260 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  56.18 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01720  thiazole-phosphate synthase  56.3 
 
 		 268 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07980  thiazole-phosphate synthase  54.24 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1154  thiazole biosynthesis family protein  54.92 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0195  thiazole synthase  59.11 
 
 		 256 aa  254  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10422  thiazole synthase  58.85 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0958619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  54.33 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1338  thiazole biosynthesis family protein  56 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.98593  hitchhiker  0.000526454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  53.94 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  52.78 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0493  thiazole biosynthesis family protein  57.25 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  52.23 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  52.33 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  51.97 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  52.38 
 
 		 273 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  52.38 
 
 		 273 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  50.99 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  49.8 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  49.81 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  48.69 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  49.02 
 
 		 267 aa  235  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  49.02 
 
 		 258 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  47.17 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  50.58 
 
 		 260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  48 
 
 		 347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0619  thiazole synthase  50.2 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0034  thiazole synthase  48.86 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  50.41 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  45.63 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  47.84 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  49.41 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0698  thiazole synthase  49.39 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0642  thiazole synthase  49.39 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0642  thiazole synthase  49.39 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0732  thiazole synthase  49.39 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0809  thiazole synthase  49.39 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56378e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0886  thiazole synthase  48.99 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000535292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0789  thiazole synthase  48.99 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4542  thiazole synthase  48.99 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0802  thiazole synthase  49.39 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  47.49 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1269  thiazole synthase  48.59 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0262061  hitchhiker  0.00290038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02980  thiazole synthase  48.63 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  48.63 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  48.63 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  48.63 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3503  thiazole biosynthesis family protein  47.69 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0648  thiazole synthase  48.99 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04980  thiazole synthase  47.31 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0480  thiazole synthase  47.31 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  47.27 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1839  thiazole synthase  44.23 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0613  thiazole synthase  49.19 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3403  thiazole synthase  49.4 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.876898  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2464  thiazole biosynthesis family protein  45.39 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3236  thiazole biosynthesis family protein  47.15 
 
 		 264 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3190  thiazole biosynthesis family protein  46.77 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  48.58 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4740  thiazole synthase  46.33 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0361  thiazole synthase  46.72 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0643  thiamin biosynthesis protein ThiG  47.29 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.924132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0434  thiazole biosynthesis protein ThiG  46.33 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0793  thiazole biosynthesis family protein  47.29 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.372773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5330  thiazole synthase  45.56 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  44.66 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  46.12 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  47.69 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3633  thiazole biosynthesis family protein  45.79 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01841  thiazole synthase  46.56 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3288  thiazole synthase  48.24 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5104  thiazole synthase  45.98 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5154  thiazole synthase  45.98 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.65179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4977  thiazole synthase  45.98 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.04 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  45.95 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  47.51 
 
 		 326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0070  thiazole synthase  48.06 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.496923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0248  thiazole synthase  46.15 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  44.31 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>