297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5154 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4977  thiazole synthase  100 
 
 		 270 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5104  thiazole synthase  100 
 
 		 270 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5154  thiazole synthase  100 
 
 		 270 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.65179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0361  thiazole synthase  94.44 
 
 		 264 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148225  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0434  thiazole biosynthesis protein ThiG  89.26 
 
 		 264 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4740  thiazole synthase  89.26 
 
 		 264 aa  497  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5330  thiazole synthase  89.26 
 
 		 264 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  86.67 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02980  thiazole synthase  85.93 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0480  thiazole synthase  84.85 
 
 		 265 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04980  thiazole synthase  84.47 
 
 		 265 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0070  thiazole synthase  72.03 
 
 		 264 aa  387  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.496923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3236  thiazole biosynthesis family protein  69.66 
 
 		 264 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2126  thiazole synthase  71.1 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0248  thiazole synthase  69.77 
 
 		 274 aa  377  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3190  thiazole biosynthesis family protein  69.32 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0224  thiazole synthase  69.38 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  68.2 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0034  thiazole synthase  70.23 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2464  thiazole biosynthesis family protein  68.18 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2637  thiazole synthase  69.73 
 
 		 259 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3503  thiazole biosynthesis family protein  70.11 
 
 		 269 aa  371  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  68.2 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1983  thiazole synthase  65.06 
 
 		 275 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3146  thiazole synthase  67.66 
 
 		 266 aa  367  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711533  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2061  thiazole synthase  65.06 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.864021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4064  thiazole synthase  67.8 
 
 		 261 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1839  thiazole synthase  64.58 
 
 		 282 aa  363  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01841  thiazole synthase  67.05 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1824  thiazole biosynthesis family protein  68.08 
 
 		 263 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3861  thiazole synthase  65.9 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0385604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  66.02 
 
 		 262 aa  350  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0643  thiamin biosynthesis protein ThiG  62.78 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.924132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0793  thiazole biosynthesis family protein  62.78 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.372773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1269  thiazole synthase  61.71 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0262061  hitchhiker  0.00290038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  66.28 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  64.39 
 
 		 329 aa  340  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  62.17 
 
 		 260 aa  322  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  62.55 
 
 		 260 aa  322  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  57.89 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  62.45 
 
 		 260 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3288  thiazole synthase  62.5 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  60.61 
 
 		 258 aa  315  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  60.67 
 
 		 260 aa  314  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  61.36 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  59.25 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  60.77 
 
 		 331 aa  305  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2568  thiazole synthase  60.23 
 
 		 268 aa  303  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  54.48 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  60.38 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  58.46 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  57.41 
 
 		 374 aa  293  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  56.93 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  58.46 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  58.46 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  58.46 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0483  thiazole synthase  55.43 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.525067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  55.38 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0217  thiazole synthase  54.94 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  53.79 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2164  thiazole biosynthesis family protein  52.94 
 
 		 263 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  53.88 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  53.61 
 
 		 652 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  54.51 
 
 		 252 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  52.31 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  50.57 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  51.16 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0613  thiazole synthase  53.57 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  51.34 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3633  thiazole biosynthesis family protein  53.58 
 
 		 281 aa  259  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  51.71 
 
 		 279 aa  258  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  50 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  51.16 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  54.05 
 
 		 666 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  54.05 
 
 		 666 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  51.15 
 
 		 262 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  53.57 
 
 		 255 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  51.76 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0619  thiazole synthase  51.78 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  50.58 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  53.79 
 
 		 260 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  50.38 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  50.98 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  50.96 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  52.73 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  49.81 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  53.41 
 
 		 684 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  49.81 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4542  thiazole synthase  50.2 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0789  thiazole synthase  50.2 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34630  thiazole-phosphate synthase  49.8 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.087197  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0642  thiazole synthase  49.8 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  48.68 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0802  thiazole synthase  49.8 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0886  thiazole synthase  49.8 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000535292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  53.26 
 
 		 286 aa  246  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  49.23 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0648  thiazole synthase  50.2 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0642  thiazole synthase  49.41 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>