299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0330 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  99.26 
 
 
271 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  99.26 
 
 
271 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  98.52 
 
 
271 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  98.15 
 
 
271 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  98.52 
 
 
271 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  92.99 
 
 
271 aa  517  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  91.88 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  91.88 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  91.88 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  91.88 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  91.88 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  91.88 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  91.88 
 
 
271 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  93.94 
 
 
274 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  89.67 
 
 
271 aa  497  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  90.04 
 
 
271 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  70.3 
 
 
278 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  66.42 
 
 
272 aa  380  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  69.23 
 
 
275 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  67.78 
 
 
282 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  69.58 
 
 
275 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  68.4 
 
 
275 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  66.67 
 
 
269 aa  362  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  66.54 
 
 
270 aa  333  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  61.73 
 
 
279 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  66.91 
 
 
270 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  59.85 
 
 
269 aa  332  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  62.31 
 
 
273 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  63.46 
 
 
271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  65.12 
 
 
280 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  58.82 
 
 
260 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  58.59 
 
 
260 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  58.2 
 
 
260 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  54.37 
 
 
265 aa  308  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  59.38 
 
 
265 aa  308  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  59.76 
 
 
256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  54.3 
 
 
262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  53.82 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  56.64 
 
 
260 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  55.47 
 
 
266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  53.12 
 
 
262 aa  299  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  55.47 
 
 
260 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  55.08 
 
 
260 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  55.86 
 
 
260 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  58.75 
 
 
277 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  55.91 
 
 
256 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  57.2 
 
 
259 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  56.8 
 
 
259 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  54.37 
 
 
267 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  56.88 
 
 
271 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  57.37 
 
 
254 aa  289  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  57.48 
 
 
256 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  57.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  56.82 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  55.3 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  57.54 
 
 
264 aa  279  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  55.73 
 
 
256 aa  278  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  57.37 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  59.36 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  49.81 
 
 
261 aa  273  3e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  50.2 
 
 
261 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  50.6 
 
 
257 aa  263  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  57.37 
 
 
257 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  56.63 
 
 
257 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  51.24 
 
 
272 aa  248  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  50.97 
 
 
291 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  51.75 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  53.39 
 
 
256 aa  241  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  50.97 
 
 
259 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  49.03 
 
 
262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  48.82 
 
 
272 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
256 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  46.06 
 
 
258 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  49.21 
 
 
252 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  48.62 
 
 
266 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  48.21 
 
 
252 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  47.73 
 
 
272 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  44.66 
 
 
666 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  44.66 
 
 
666 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  47.24 
 
 
256 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  44.75 
 
 
260 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  49.41 
 
 
254 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  44.49 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  40.6 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  43.97 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  45.63 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  46.27 
 
 
257 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  49 
 
 
263 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  48.82 
 
 
260 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1338  thiazole biosynthesis family protein  48 
 
 
264 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.98593  hitchhiker  0.000526454 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  43.35 
 
 
263 aa  216  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  47.06 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  46.06 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  42.7 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 
262 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34630  thiazole-phosphate synthase  49 
 
 
261 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.087197  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  44.49 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  43.36 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>