More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2466 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  80.3 
 
 		 269 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  77.86 
 
 		 273 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  74.71 
 
 		 272 aa  417  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  78.6 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  75.94 
 
 		 271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  76.69 
 
 		 270 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  76.81 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  70.22 
 
 		 275 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  69.85 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  70.22 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  70.38 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  69.03 
 
 		 282 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  63.87 
 
 		 274 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  64.29 
 
 		 271 aa  351  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  64.29 
 
 		 271 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  62.92 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  347  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  61.73 
 
 		 271 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  61.73 
 
 		 271 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  63.77 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  62.55 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  62.55 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  62.45 
 
 		 271 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  61.01 
 
 		 271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  58.85 
 
 		 269 aa  315  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  57.92 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  57.59 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  58.17 
 
 		 259 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  56.86 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  58.17 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  56.11 
 
 		 265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  57.2 
 
 		 260 aa  305  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  59.18 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  56.03 
 
 		 260 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  54.86 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  53.94 
 
 		 273 aa  298  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  54.86 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  55.08 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  58.3 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  55.25 
 
 		 262 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  55.29 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  54.47 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  55.64 
 
 		 265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  55.95 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  56.57 
 
 		 254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  53.61 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  53.28 
 
 		 277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  53.58 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  57.31 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  55.29 
 
 		 256 aa  275  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  55.29 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  57.47 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  55.08 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  50 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  48.84 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  52.57 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  48.41 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  56.75 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  54.51 
 
 		 257 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  44.88 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  44.27 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  46.3 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  43.7 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  42.69 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  43.82 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  44.75 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  45.85 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  42.75 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  45.67 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3288  thiazole synthase  43.49 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  43.45 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  42.8 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  42.41 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  44.29 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  45.82 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  45.6 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  43.3 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  46.4 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  45.02 
 
 		 256 aa  214  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  46.25 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  44.27 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  42.29 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  46.12 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  43.3 
 
 		 263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0793  thiazole biosynthesis family protein  43.97 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.372773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  42.97 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0643  thiamin biosynthesis protein ThiG  43.97 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.924132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  45.02 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  43.19 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1824  thiazole biosynthesis family protein  45 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.36 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  44.49 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  42.25 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>