More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1454 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  100 
 
 		 269 aa  557  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  62.84 
 
 		 265 aa  349  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  61.39 
 
 		 266 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  61.89 
 
 		 275 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  60.23 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  59.85 
 
 		 274 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  62.07 
 
 		 275 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  59.85 
 
 		 271 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  59.07 
 
 		 262 aa  334  7e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  59.07 
 
 		 262 aa  334  7.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  62.07 
 
 		 275 aa  334  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  59.7 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  59.7 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  61.33 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  60.23 
 
 		 271 aa  332  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  59.85 
 
 		 271 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  59.85 
 
 		 271 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  59.32 
 
 		 271 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  59.46 
 
 		 271 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  58.8 
 
 		 273 aa  328  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  60.55 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  60 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  59.77 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  58.69 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  58.69 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  58.69 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  58.69 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  58.69 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  58.69 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  58.69 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  57.14 
 
 		 282 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  57.92 
 
 		 271 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  58.59 
 
 		 260 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  58.02 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  58.3 
 
 		 271 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  57.92 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  57.42 
 
 		 260 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  57.42 
 
 		 260 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  57.03 
 
 		 260 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  56.54 
 
 		 272 aa  314  9e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  58.27 
 
 		 256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  58.62 
 
 		 269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  59.3 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  55.86 
 
 		 267 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  57.49 
 
 		 259 aa  308  8e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  57.49 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  54.62 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  57.2 
 
 		 265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  54.09 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  58.85 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  59.06 
 
 		 256 aa  295  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  59.06 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  57.25 
 
 		 273 aa  292  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  54.8 
 
 		 256 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  57.47 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  56.2 
 
 		 280 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  58.62 
 
 		 270 aa  285  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  58.24 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  56.63 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  55.16 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  54.51 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  50.98 
 
 		 257 aa  272  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  52.96 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  54.3 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  47.24 
 
 		 272 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  52.57 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  48.45 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  54.37 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  46.46 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  44.57 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  45.74 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  47.47 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  45.17 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  45.85 
 
 		 259 aa  232  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  46.72 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  44.87 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  44.57 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  45.28 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  44.83 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  47.01 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  44.57 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  44.57 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1417  thiazole synthase  47.13 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  46.06 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  46.25 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  44.75 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  46.37 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  44.22 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  44.76 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  45.28 
 
 		 263 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  44.75 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  45 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  47.48 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  45.35 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  45.02 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  46.22 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  45.67 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  44.09 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  43.46 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  44.62 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>