299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2396 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  100 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  85.5 
 
 		 269 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  85.56 
 
 		 271 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  82.24 
 
 		 280 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  82.35 
 
 		 270 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  81.99 
 
 		 270 aa  417  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  77.86 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  72.9 
 
 		 272 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  70.85 
 
 		 275 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  70.48 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  70.11 
 
 		 275 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  69.47 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  67.92 
 
 		 282 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  64.15 
 
 		 271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  63.77 
 
 		 271 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  63.74 
 
 		 274 aa  351  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  62.31 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  62.31 
 
 		 271 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  61.94 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  64.12 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  63.74 
 
 		 271 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  63.74 
 
 		 271 aa  345  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  63.36 
 
 		 271 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  60.62 
 
 		 260 aa  322  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  60.7 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  59.14 
 
 		 260 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  57.25 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  58.43 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  59.69 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  58.89 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  59.3 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  58.37 
 
 		 260 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  57.2 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  56.81 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  54.3 
 
 		 273 aa  301  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  57.69 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  54.65 
 
 		 266 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  57.2 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  54.17 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  55.09 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  56.93 
 
 		 272 aa  292  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  54.09 
 
 		 262 aa  291  7e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  56.11 
 
 		 277 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  57.48 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  53.7 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  57.71 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  55.17 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  54.86 
 
 		 256 aa  275  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  54.86 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  50.79 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  55.85 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  50.78 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  55.69 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  53.33 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  55.43 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  47.69 
 
 		 261 aa  262  4.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  54.86 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  56.3 
 
 		 257 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  49.81 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  48.05 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  47.17 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  48.22 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  46.9 
 
 		 272 aa  228  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  46.59 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  46.88 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  47.04 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  46.54 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  45.59 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  46.86 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  42.64 
 
 		 267 aa  222  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  41.41 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  47.84 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  46.64 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  47.43 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  43.14 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  46.25 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  46.32 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  44.83 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  41.86 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  46.33 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  46.27 
 
 		 276 aa  212  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0643  thiamin biosynthesis protein ThiG  44.79 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.924132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0793  thiazole biosynthesis family protein  44.79 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.372773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  41.41 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  44.66 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  44.36 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34630  thiazole-phosphate synthase  46.46 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.087197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  45.02 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  44.22 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  46.67 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  42.58 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  42.19 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>