299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2164 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  100 
 
 		 260 aa  520  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  85.77 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  86.54 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  86.15 
 
 		 260 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  86.15 
 
 		 260 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  86.15 
 
 		 260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  83.85 
 
 		 260 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  67.06 
 
 		 256 aa  354  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  66.93 
 
 		 265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  60.32 
 
 		 273 aa  335  5e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  64.8 
 
 		 267 aa  334  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  66.67 
 
 		 256 aa  333  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  62.3 
 
 		 257 aa  333  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  66.27 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  65.86 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  59.22 
 
 		 266 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  66.8 
 
 		 258 aa  325  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  62.06 
 
 		 269 aa  321  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  61.2 
 
 		 259 aa  318  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  60.8 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  57.03 
 
 		 269 aa  316  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  63.49 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  59.29 
 
 		 275 aa  314  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  55.38 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  58.5 
 
 		 275 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  59.76 
 
 		 275 aa  311  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  58.3 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  55.38 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  56.15 
 
 		 261 aa  308  5e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  55.38 
 
 		 261 aa  308  8e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  57.42 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  57.42 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  61.9 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  57.03 
 
 		 271 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  57.03 
 
 		 271 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  62.3 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  57.81 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  58.04 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  56.64 
 
 		 271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  56.64 
 
 		 271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  56.25 
 
 		 271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  52.69 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  57.42 
 
 		 271 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  56.25 
 
 		 274 aa  301  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  64.29 
 
 		 257 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  60.47 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  56.64 
 
 		 271 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  59.22 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  54.55 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  59.61 
 
 		 293 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  62.3 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  58.43 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  58.5 
 
 		 280 aa  291  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  56.86 
 
 		 279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  56.13 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  58.37 
 
 		 272 aa  284  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  57.42 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  57.71 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  57.71 
 
 		 270 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  49.23 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 273 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  51.37 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  50.59 
 
 		 258 aa  224  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  46.03 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  51.81 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  51.41 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  51.2 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  51.39 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  45.6 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  49.41 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  50.6 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  45.2 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  49.8 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  45.95 
 
 		 261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  48.64 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  48.91 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  49.61 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  46.56 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  46.56 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  46.22 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3503  thiazole biosynthesis family protein  46.09 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  47.01 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  47.79 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  49.4 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  47.27 
 
 		 327 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  44.4 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  45.24 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  50.63 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  46.15 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  49.21 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.142518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>