More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3652 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  76.08 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  72.83 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  71.37 
 
 		 254 aa  374  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  68.77 
 
 		 265 aa  363  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  71.09 
 
 		 256 aa  362  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  70.7 
 
 		 256 aa  361  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  68.75 
 
 		 256 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  68.77 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  66.67 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  65.76 
 
 		 257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  66.93 
 
 		 257 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  66.93 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  59.53 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  59.61 
 
 		 260 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  59.61 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  58.43 
 
 		 260 aa  308  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  59.61 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  59.22 
 
 		 260 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  59.22 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  56.4 
 
 		 273 aa  305  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  58.82 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  57.65 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  57.65 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  56.92 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  56.8 
 
 		 266 aa  294  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  56.92 
 
 		 271 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  58.2 
 
 		 275 aa  292  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  56.52 
 
 		 271 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  56.13 
 
 		 275 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  56.52 
 
 		 271 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  55.91 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  56.13 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  55.34 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  56.13 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  55.34 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  56.92 
 
 		 269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  53.88 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  55.73 
 
 		 271 aa  284  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  55.25 
 
 		 277 aa  278  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  52.96 
 
 		 269 aa  278  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  56 
 
 		 271 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  52.94 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  52.16 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  56.13 
 
 		 280 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  50.99 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  56.13 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  55.34 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  52.94 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  55.73 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  55.73 
 
 		 270 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  54.15 
 
 		 271 aa  265  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  50.59 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  53.33 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  52.57 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  48.25 
 
 		 265 aa  258  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  51.61 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  51.21 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  51.05 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  48.19 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  47.37 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  47.37 
 
 		 273 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  47.37 
 
 		 273 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  49.4 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  48.78 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  48.41 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  48.79 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  48.4 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  44.53 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  49.37 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1284  thiazole biosynthesis protein ThiG  45.45 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  48.44 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  46 
 
 		 296 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  46.53 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  46.09 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  46.15 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  47.5 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  47.46 
 
 		 272 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0710  thiazole synthase  48.37 
 
 		 265 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.528279  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3403  thiazole synthase  45.78 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.876898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  44.53 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  43.72 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  42.69 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  46.69 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  46.44 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  46.44 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  46.44 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2500  thiazole synthase  45.16 
 
 		 276 aa  198  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000745865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  45.53 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>