299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1416 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  100 
 
 
265 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  80.31 
 
 
267 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  74.8 
 
 
256 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  75 
 
 
256 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  73.23 
 
 
256 aa  374  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  72.83 
 
 
256 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  68.9 
 
 
254 aa  354  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  68.77 
 
 
256 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  70.2 
 
 
264 aa  348  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  67.72 
 
 
260 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  69.96 
 
 
258 aa  345  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  66.54 
 
 
260 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  66.93 
 
 
260 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  66.93 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  64.43 
 
 
260 aa  334  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  65.35 
 
 
260 aa  334  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  64.17 
 
 
260 aa  332  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  67.59 
 
 
257 aa  327  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  69.05 
 
 
257 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  60.47 
 
 
257 aa  323  1e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  58.8 
 
 
273 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  58.82 
 
 
266 aa  318  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  59.77 
 
 
275 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  59.77 
 
 
275 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  61.33 
 
 
271 aa  315  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  57.99 
 
 
282 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  60.31 
 
 
275 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  59.77 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  60.55 
 
 
271 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  60.94 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  60.16 
 
 
274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  66.93 
 
 
257 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  60.16 
 
 
271 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  59.38 
 
 
271 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  59.38 
 
 
271 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  57.95 
 
 
278 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  59.38 
 
 
271 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  58.98 
 
 
271 aa  308  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  60.23 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  57.2 
 
 
269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  58.4 
 
 
259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  58.4 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  59.92 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  53.31 
 
 
272 aa  298  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  60 
 
 
280 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  58.02 
 
 
293 aa  294  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  57.69 
 
 
273 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  52.96 
 
 
262 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  59.53 
 
 
270 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  52.96 
 
 
262 aa  285  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  59.14 
 
 
270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  56.92 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  58.37 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  54.94 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  50 
 
 
265 aa  279  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  52.76 
 
 
261 aa  278  6e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  52.76 
 
 
261 aa  275  7e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  55.64 
 
 
279 aa  274  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  49.39 
 
 
272 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  49.21 
 
 
273 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  49.21 
 
 
273 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  49.21 
 
 
269 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  48.43 
 
 
267 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  49.03 
 
 
259 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  49.21 
 
 
291 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  49.41 
 
 
256 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  51.18 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  46.48 
 
 
258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  46.06 
 
 
260 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  47.39 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  47.43 
 
 
256 aa  214  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  47.83 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  47.83 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  47.83 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  50.39 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  47.45 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  47.83 
 
 
257 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  45.1 
 
 
260 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  44.23 
 
 
267 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  46.61 
 
 
266 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  44.66 
 
 
260 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.33 
 
 
326 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  47.22 
 
 
272 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1839  thiazole synthase  42.97 
 
 
282 aa  204  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  46.85 
 
 
296 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  51.08 
 
 
259 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3236  thiazole biosynthesis family protein  44.79 
 
 
264 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  47.45 
 
 
254 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  43.31 
 
 
260 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  46.64 
 
 
252 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  46.88 
 
 
265 aa  202  6e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>