299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3430 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  94.62 
 
 		 260 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  93.85 
 
 		 260 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  88.46 
 
 		 260 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  85.38 
 
 		 260 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  86.54 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  83.46 
 
 		 260 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  67.06 
 
 		 256 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  67.72 
 
 		 265 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  65.34 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  63.49 
 
 		 257 aa  339  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  65.06 
 
 		 256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  61.85 
 
 		 266 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  58.96 
 
 		 273 aa  333  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  65.48 
 
 		 254 aa  328  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  65.49 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  65.73 
 
 		 258 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  65.1 
 
 		 256 aa  325  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  60.08 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  58.59 
 
 		 269 aa  321  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  60.08 
 
 		 275 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  59.3 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  61.29 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  60.89 
 
 		 259 aa  318  6e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  55.38 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  60.78 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  64.29 
 
 		 257 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  55 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  56.7 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  65.87 
 
 		 257 aa  309  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  57.59 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  61.18 
 
 		 271 aa  305  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  54.62 
 
 		 265 aa  304  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  62.3 
 
 		 264 aa  304  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  55.29 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  54.23 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  59.61 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  55 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  55.47 
 
 		 274 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  64.29 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  56.25 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  55.86 
 
 		 271 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  55.86 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  55.86 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  55.86 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  55.86 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  55.86 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  55.47 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  55.47 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  55.08 
 
 		 271 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  58.82 
 
 		 280 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  57.94 
 
 		 293 aa  295  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  57.59 
 
 		 277 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  58.37 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  55.6 
 
 		 271 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  56.03 
 
 		 279 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  57.37 
 
 		 272 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  56.86 
 
 		 270 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  56.86 
 
 		 270 aa  278  8e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  50.38 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  50.41 
 
 		 273 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  50.41 
 
 		 273 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  46.03 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  50.41 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  47.41 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  50.39 
 
 		 291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  52.05 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  44.8 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  45.14 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  51.64 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  50.41 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  44 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  50.4 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  47.83 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  45.38 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  47.84 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  46.56 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  48.8 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  46.75 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  45.6 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  45.6 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  45.6 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  49.6 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  49.19 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  45.12 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  46.22 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  46.34 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  49.59 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  44.84 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  47.98 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  50.22 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>