More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0039 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  73.23 
 
 
256 aa  377  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  73.91 
 
 
256 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  75.79 
 
 
264 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  71.37 
 
 
256 aa  362  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  73.12 
 
 
256 aa  357  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  72.73 
 
 
256 aa  356  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  68.9 
 
 
265 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  68.8 
 
 
267 aa  353  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  65.48 
 
 
260 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  65.08 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  64.68 
 
 
260 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  64.29 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  65.08 
 
 
260 aa  317  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  63.49 
 
 
260 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  63.49 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  64.2 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  64.82 
 
 
257 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  58.1 
 
 
257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  61.26 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  61.26 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  65.62 
 
 
257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  61.75 
 
 
269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  60.87 
 
 
275 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  58.5 
 
 
278 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  58.17 
 
 
274 aa  295  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  59.36 
 
 
271 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  58.96 
 
 
271 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  64.45 
 
 
257 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  56.03 
 
 
282 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  56.97 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  56.97 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  56.97 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  56.97 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  56.97 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  56.97 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  56.97 
 
 
271 aa  291  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  57.77 
 
 
271 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  56.57 
 
 
271 aa  288  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  57.37 
 
 
271 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  57.37 
 
 
271 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  57.37 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  57.37 
 
 
271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  57.37 
 
 
271 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  56.57 
 
 
271 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  58.96 
 
 
280 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  55.06 
 
 
273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  59.76 
 
 
271 aa  281  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  56.63 
 
 
269 aa  280  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  56.4 
 
 
259 aa  279  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  56.4 
 
 
259 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  57.2 
 
 
293 aa  278  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  52.99 
 
 
272 aa  278  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  56.03 
 
 
277 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  57.71 
 
 
273 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  58.57 
 
 
270 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  58.57 
 
 
270 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  56.57 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  54.25 
 
 
266 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  56.45 
 
 
271 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  53.66 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  53.47 
 
 
262 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  50.4 
 
 
265 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  56.05 
 
 
272 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  51.61 
 
 
261 aa  258  6e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  50.81 
 
 
261 aa  256  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  55.6 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  54.4 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  52.63 
 
 
267 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  52.23 
 
 
273 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  52.23 
 
 
273 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  52.23 
 
 
269 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  48.77 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  51.23 
 
 
256 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  49.01 
 
 
291 aa  217  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  46.61 
 
 
258 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 
256 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  49.39 
 
 
259 aa  208  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2481  thiazole biosynthesis family protein  52.54 
 
 
259 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.1272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  47.41 
 
 
254 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  48.19 
 
 
281 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  44.62 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  49.6 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1284  thiazole biosynthesis protein ThiG  44.4 
 
 
270 aa  198  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  45.28 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01720  thiazole-phosphate synthase  48.36 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  47.54 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  46.22 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  44 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  46.59 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  47.62 
 
 
260 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  45.53 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1755  thiazole synthase  44.62 
 
 
256 aa  194  9e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  44.22 
 
 
260 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  46 
 
 
272 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  43.43 
 
 
260 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  46.5 
 
 
259 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  44.86 
 
 
256 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  46.69 
 
 
257 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  46.69 
 
 
257 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>