299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2433 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2433  thiazole biosynthesis family protein  100 
 
 
277 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1607  thiamine biosynthesis protein ThiG  72.49 
 
 
293 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153075  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1454  thiazole synthase  59.77 
 
 
269 aa  326  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150113  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1746  thiazole synthase  58.85 
 
 
259 aa  324  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0440  thiazole synthase  58.85 
 
 
259 aa  324  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0170982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2164  thiazole biosynthesis family protein  58.85 
 
 
267 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.250593  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1525  thiazole synthase  56.42 
 
 
262 aa  305  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1458  thiazole synthase  56.42 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1416  thiazole biosynthesis family protein  59.92 
 
 
265 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0145  thiazole synthase  56.87 
 
 
273 aa  301  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0253  thiazole synthase  56.42 
 
 
265 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.745553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2772  thiazole synthase  59.14 
 
 
274 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0230325  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0040  thiazole synthase  58.46 
 
 
271 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2695  thiazole synthase  57.74 
 
 
271 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6224  thiazole synthase  58.59 
 
 
260 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0470845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0412  thiazole synthase  57.74 
 
 
271 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0165  thiazole synthase  58.8 
 
 
282 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0339  thiazole synthase  58.75 
 
 
271 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242802  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0330  thiazole synthase  58.75 
 
 
271 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3645  thiazole synthase  59.39 
 
 
275 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3573  thiazole synthase  59.14 
 
 
271 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0385  thiazole synthase  59.14 
 
 
271 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2893  thiazole synthase  58.43 
 
 
260 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.594145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0315  thiazole synthase  58.37 
 
 
271 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.655827  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1934  thiazole synthase  54.44 
 
 
266 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0282  thiazole synthase  58.69 
 
 
256 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0391  thiazole synthase  57.36 
 
 
271 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.823681  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3006  thiazole synthase  57.98 
 
 
271 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2728  thiazole synthase  57.59 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2778  thiazole synthase  57.59 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3707  thiazole synthase  57.59 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3226  thiazole synthase  57.59 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3510  thiazole synthase  58.37 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1775  thiazole synthase  57.59 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3737  thiazole synthase  57.59 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.460911  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3679  thiazole synthase  57.59 
 
 
271 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.80639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3321  thiazole synthase  58.62 
 
 
275 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2466  thiazole synthase  58.2 
 
 
260 aa  292  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.484208  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3430  thiazole synthase  57.59 
 
 
260 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0208  thiazole synthase  57.58 
 
 
278 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0109  thiazole synthase  58.62 
 
 
275 aa  288  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.114062  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1956  thiazole synthase  56.86 
 
 
260 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0011  thiazole synthase  58.91 
 
 
256 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal  0.188249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2164  thiazole synthase  57.42 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.323529  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4094  thiazole synthase  55.64 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0022  thiazole synthase  57.31 
 
 
272 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.675637  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0206  thiazole synthase  57.59 
 
 
256 aa  281  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.509897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0893  thiazole synthase  53.31 
 
 
272 aa  281  9e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00790256  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0215  thiazole synthase  57.59 
 
 
256 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3070  thiazole synthase  57.98 
 
 
269 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0377281  normal  0.633665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0039  thiazole synthase  56.03 
 
 
254 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138828  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0912  thiazole biosynthesis family protein  56.34 
 
 
264 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2396  thiazole synthase  56.11 
 
 
273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0443  thiazole synthase  52.36 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0797  thiazole synthase  50.19 
 
 
261 aa  273  3e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6398  thiazole synthase  58.5 
 
 
257 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3652  thiazole synthase  55.25 
 
 
256 aa  271  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0206  thiazole synthase  49.42 
 
 
261 aa  270  2e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2466  thiazole synthase  53.28 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.383957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3291  thiazole synthase  55.29 
 
 
280 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.251536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2564  thiazole synthase  55.86 
 
 
258 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.741559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4312  thiazole synthase  54.89 
 
 
271 aa  264  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1938  thiazole synthase  55.89 
 
 
270 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4171  thiazole synthase  57.31 
 
 
257 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534957  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1784  thiazole synthase  55.89 
 
 
270 aa  255  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5920  thiazole synthase  56.69 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  47.67 
 
 
272 aa  243  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  52.12 
 
 
259 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  47.74 
 
 
267 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  51.74 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  48.51 
 
 
269 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
273 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  47.6 
 
 
273 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  48.45 
 
 
291 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  51.41 
 
 
260 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  45.98 
 
 
263 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  49.44 
 
 
272 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  50.8 
 
 
259 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  48.86 
 
 
265 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  51.6 
 
 
261 aa  224  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  48.22 
 
 
265 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  50 
 
 
281 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2500  thiazole synthase  46.15 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000745865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  48.39 
 
 
259 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  45.14 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  48.99 
 
 
258 aa  218  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  46.92 
 
 
296 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  49.41 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  45.63 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  45.02 
 
 
267 aa  216  5e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  47.35 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  45.85 
 
 
259 aa  215  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  49.41 
 
 
263 aa  215  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  44.92 
 
 
260 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  50.2 
 
 
252 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  46.75 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  46 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  46.53 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2779  thiazole synthase  46.27 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  49.62 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>