More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00142 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00142  thiazole synthase  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  68.77 
 
 
261 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  67.84 
 
 
259 aa  353  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2197  thiazole synthase  66.15 
 
 
269 aa  350  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.156916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  67.45 
 
 
259 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  68.25 
 
 
260 aa  348  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2017  thiazole biosynthesis family protein  65.87 
 
 
254 aa  346  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.706865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002076  thiazole biosynthesis protein ThiG  64.82 
 
 
255 aa  344  8.999999999999999e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  67.86 
 
 
258 aa  343  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  64.43 
 
 
255 aa  342  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2379  thiazole biosynthesis family protein  65.08 
 
 
254 aa  342  4e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1774  thiazole synthase  65.22 
 
 
266 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0203  thiazole synthase  66.8 
 
 
256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4438  thiazole synthase  66.01 
 
 
271 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000032943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  66.01 
 
 
256 aa  338  7e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  66.01 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2588  thiazole biosynthesis family protein  62.7 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59358  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  66.01 
 
 
256 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5458  thiazole synthase  65.62 
 
 
271 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.12937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  65.61 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  65.61 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  65.61 
 
 
256 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  65.61 
 
 
256 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4490  thiazole synthase  65.61 
 
 
256 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810094 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4566  thiazole synthase  65.22 
 
 
261 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4403  thiazole synthase  65.61 
 
 
256 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4370  thiazole synthase  65.61 
 
 
256 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2092  thiazole biosynthesis family protein  63.92 
 
 
257 aa  332  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2028  thiazole synthase  63.1 
 
 
254 aa  331  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2319  thiazole synthase  63.1 
 
 
254 aa  331  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789275  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  63.74 
 
 
271 aa  331  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  63.74 
 
 
271 aa  331  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  63.74 
 
 
271 aa  331  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2026  thiazole synthase  62.7 
 
 
254 aa  330  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2435  thiazole synthase  62.7 
 
 
254 aa  330  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0679101  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2987  thiazole synthase  64.68 
 
 
256 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4492  thiazole synthase  65.22 
 
 
261 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739018  hitchhiker  0.00000139222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1885  thiazole synthase  61.26 
 
 
254 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  63.49 
 
 
265 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1926  thiazole synthase  62.7 
 
 
254 aa  328  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2093  thiazole synthase  61.26 
 
 
254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.61788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1940  thiazole synthase  61.11 
 
 
252 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1856  thiazole synthase  63.1 
 
 
271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0045  thiazole synthase  63.1 
 
 
259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0368831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2441  thiazole synthase  60.47 
 
 
254 aa  325  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  63.1 
 
 
257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2461  thiazole biosynthesis family protein  62.06 
 
 
255 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2449  thiazole synthase  64.43 
 
 
256 aa  322  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2389  thiazole biosynthesis family protein  60.56 
 
 
258 aa  318  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.673055  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  62.75 
 
 
255 aa  318  7e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6574  thiazole biosynthesis family protein  62.8 
 
 
259 aa  315  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  62.15 
 
 
258 aa  315  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2108  thiazole synthase  59.68 
 
 
259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1599  thiazole biosynthesis family protein  59.52 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1821  thiazole synthase  58.73 
 
 
256 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1663  thiazole synthase  54.98 
 
 
255 aa  271  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000271771  hitchhiker  0.00109923 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1267  thiazole synthase  55.42 
 
 
256 aa  271  7e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0609  thiazole synthase  55.56 
 
 
258 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0669108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0339  thiazole synthase  55.56 
 
 
258 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1565  thiazole synthase  54.37 
 
 
275 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0719115 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2003  thiazole synthase  57.14 
 
 
259 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0730  thiazole synthase  53.36 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1836  thiazole synthase  55.38 
 
 
303 aa  261  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138321  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0716  thiazole synthase  54.51 
 
 
260 aa  260  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000103869  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1556  thiazole synthase  53.91 
 
 
259 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.765311  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0665  thiazole synthase  54.76 
 
 
259 aa  259  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1639  thiazole synthase  53.49 
 
 
277 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  52.34 
 
 
666 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  52.34 
 
 
666 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2221  thiazole synthase  49.04 
 
 
279 aa  248  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0073  thiazole biosynthesis family protein  52.96 
 
 
257 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18541  thiazole synthase  50 
 
 
264 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1756  thiazole synthase  50 
 
 
264 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0576  thiazole synthase  52.51 
 
 
286 aa  246  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.0505529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  52.73 
 
 
652 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18731  thiazole synthase  49.6 
 
 
264 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  52.73 
 
 
684 aa  245  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0598  thiazole synthase  50 
 
 
255 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0051  thiazole synthase  50.78 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3076  thiazole synthase  53.75 
 
 
337 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1921  thiazole synthase  51.42 
 
 
267 aa  241  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.142518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  51.22 
 
 
262 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2043  thiazole biosynthesis family protein  51.81 
 
 
265 aa  238  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0368  thiazole biosynthesis family protein  51.2 
 
 
265 aa  238  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.263226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  52.34 
 
 
652 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1916  thiazole biosynthesis family protein  46.43 
 
 
262 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1262  thiazole synthase  46.33 
 
 
268 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0776  thiazole biosynthesis family protein  48.24 
 
 
263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0054  thiazole synthase  51.74 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  49.41 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  49.21 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00531  thiazole synthase  47.88 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21331  thiazole synthase  45.95 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0075  thiazole synthase  49 
 
 
253 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0800  thiazole synthase  49.41 
 
 
266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17901  thiazole synthase  48.65 
 
 
275 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00995921  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18541  thiazole synthase  50.39 
 
 
265 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.586364  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0727  thiazole biosynthesis family protein  48.81 
 
 
261 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329122  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1136  thiazole synthase  48.81 
 
 
265 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0568809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0807  thiazole synthase  47.43 
 
 
289 aa  229  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.304332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>