279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1279 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.82 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  58.45 
 
 		 239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.19 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.55 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  52.29 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  55.19 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  53.89 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  48.22 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  42.66 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.37 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  48.04 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  45.62 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.18 
 
 		 232 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  47.42 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.44 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.66 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.55 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  42.73 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.7 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.03 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.45 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.18 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.14 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.33 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  39.82 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  40.18 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  43.78 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.3 
 
 		 238 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  44.21 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.13 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  43.24 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  42.16 
 
 		 242 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.18 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.69 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  42.16 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  42.25 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.4 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  42.16 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  42.16 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.16 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  43.55 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  41.94 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  37.26 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  41.12 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  38.79 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.26 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  42.33 
 
 		 220 aa  138  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  41.53 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.32 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  45.8 
 
 		 134 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  45.04 
 
 		 134 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  45.04 
 
 		 134 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  36.56 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  41.76 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  36.67 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  44.27 
 
 		 148 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  45.67 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.07 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  32.86 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  45.04 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  35.61 
 
 		 310 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.92 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.69 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  31.65 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.53 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.65 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.3 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  36.51 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  36.51 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  33.63 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  31.78 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  36.99 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.27 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35.41 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.87 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  38.51 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.46 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.56 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.51 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.13 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.1 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  35.09 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  35.09 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  35.09 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  35.09 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  34.39 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  37.67 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.17 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  35.61 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.85 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  34.93 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.5 
 
 		 149 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  32.9 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  31.56 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>