80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6333 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  100 
 
 
237 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  80.59 
 
 
235 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  82.1 
 
 
236 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  79.74 
 
 
232 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  55.51 
 
 
510 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  50.85 
 
 
513 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  54.62 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2238  autoaggregation protein (adhering protein)  41.88 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  42.74 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30.13 
 
 
16322 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.96 
 
 
1599 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 
276 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  28.45 
 
 
3714 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  29.69 
 
 
1215 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  29.69 
 
 
1215 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.7 
 
 
3508 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.42 
 
 
496 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  29.26 
 
 
1215 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 
2555 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.13 
 
 
1215 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  30.13 
 
 
1215 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.51 
 
 
1883 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  28.22 
 
 
4748 aa  58.9  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  43.16 
 
 
497 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  39.32 
 
 
541 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  29.69 
 
 
2887 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  43.53 
 
 
537 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.65 
 
 
4978 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  34.38 
 
 
2768 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  27.39 
 
 
1269 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  31.11 
 
 
2524 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  36.57 
 
 
2251 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.47 
 
 
4122 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  28.76 
 
 
6662 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.73 
 
 
5745 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.33 
 
 
6683 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  28.33 
 
 
6779 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.66 
 
 
2239 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  31.11 
 
 
3182 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.34 
 
 
1553 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 
4836 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  25.11 
 
 
3259 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.19 
 
 
5098 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.6 
 
 
2784 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  27.73 
 
 
3758 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.84 
 
 
1706 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  39.76 
 
 
496 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  34.21 
 
 
5094 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.16 
 
 
2812 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  27.2 
 
 
3229 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  40.96 
 
 
495 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  27.49 
 
 
16311 aa  48.5  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  24.12 
 
 
3191 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  33.03 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  28.14 
 
 
4285 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 
3816 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  25.79 
 
 
5020 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  29.71 
 
 
1586 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  27.07 
 
 
3026 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  25.22 
 
 
1268 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  24.03 
 
 
1269 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.14 
 
 
4791 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 
5787 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.68 
 
 
4854 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  29.8 
 
 
3091 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  27.71 
 
 
5442 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.92 
 
 
2067 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.76 
 
 
3824 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.76 
 
 
3739 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.76 
 
 
3824 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.78 
 
 
14916 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.76 
 
 
3824 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.76 
 
 
3721 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  23.08 
 
 
9867 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 
3038 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.27 
 
 
5839 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.59 
 
 
4220 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  28 
 
 
6310 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  28.44 
 
 
8064 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  35.79 
 
 
6715 aa  41.6  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>