More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6154 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 344 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  92.44 
 
 		 344 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  73.26 
 
 		 346 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  65.56 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  47.08 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  42.6 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  38.58 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  37.98 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  40.53 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  37.17 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  36.26 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  27.12 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  27.1 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  36.24 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  25.61 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.37 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.06 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.48 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.15 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  24.13 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  26.92 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  24.42 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.61 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  23.03 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  24.35 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  23.03 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  24.82 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.25 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  21.7 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  35.57 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.03 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1858  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  23.58 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  22.67 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  24.53 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  27.96 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0896  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  30.91 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  34.12 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  30.91 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  30.91 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  33.33 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  30.91 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  30.91 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  31.9 
 
 		 493 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 383 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  22.03 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  30.91 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0616  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  25.41 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  26.28 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2177  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.782601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>