187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6002 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  100 
 
 		 136 aa  266  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  94.7 
 
 		 146 aa  244  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5416  response regulator  42.64 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122104 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4738  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  42.11 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  41.23 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  44.83 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  44.74 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0622  response regulator  39.83 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  38.6 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4406  response regulator  41.53 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402272  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4036  response regulator  41.53 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4518  response regulator  41.53 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  35.09 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  34.23 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  35.09 
 
 		 267 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7005  response regulator receiver protein  43.53 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  33.33 
 
 		 264 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  33.91 
 
 		 267 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  33.91 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  33.91 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  33.91 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  32.73 
 
 		 264 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  33.64 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  32.43 
 
 		 264 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  31.58 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  34.29 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3285  two-component response regulator  37.5 
 
 		 265 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  31.82 
 
 		 264 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  31.82 
 
 		 264 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.37 
 
 		 651 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  34.29 
 
 		 268 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  31.82 
 
 		 264 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  33.93 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  34.29 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  34.29 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  36.84 
 
 		 1096 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  33.93 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  33.96 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  33.02 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  32.71 
 
 		 273 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  31.82 
 
 		 265 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  38.39 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 472 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  38.39 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  33.04 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  33.04 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0114  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.273159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 636 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  32.74 
 
 		 271 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  36.05 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  30.09 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.29 
 
 		 650 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  36.07 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  33.33 
 
 		 207 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  28.32 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 380 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  32.14 
 
 		 269 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  31.19 
 
 		 414 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1111 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  33.33 
 
 		 657 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 602 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 1096 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  30 
 
 		 265 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  37.35 
 
 		 429 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  34.65 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 		 631 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0052  two-component response regulator  29.25 
 
 		 264 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  22.52 
 
 		 249 aa  48.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  33.02 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1210  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.680445  normal  0.444345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0287  two-component response regulator  29.2 
 
 		 264 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5755  response regulator receiver protein  31 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  40.24 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.73 
 
 		 461 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  36.27 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  35.16 
 
 		 429 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  31.48 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.95 
 
 		 481 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.55 
 
 		 561 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1059  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0315132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  35.92 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>