More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4822 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  82.37 
 
 
448 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
448 aa  910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
448 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  45.29 
 
 
446 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  43.34 
 
 
448 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  44.7 
 
 
447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  39.6 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  40.13 
 
 
448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 
443 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  35.45 
 
 
439 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
439 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
439 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  32.88 
 
 
438 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
446 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
439 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
430 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
437 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  34.11 
 
 
387 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
437 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  31 
 
 
442 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
427 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
435 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
428 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  26.39 
 
 
482 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
496 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
472 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
453 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  28.75 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
381 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
442 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  26.57 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
434 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  26.32 
 
 
427 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
425 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
424 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
429 aa  107  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
428 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
427 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
473 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
470 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
478 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
428 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
468 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
460 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
434 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
428 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 
428 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
468 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  26.75 
 
 
428 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
429 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
443 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
435 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
457 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
429 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
472 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  26.76 
 
 
470 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4329  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
453 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112213 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4439  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
453 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.839002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
428 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
462 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
427 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  27.69 
 
 
428 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
427 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
445 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
425 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.87 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
427 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  28.88 
 
 
470 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
427 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
445 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  24.66 
 
 
464 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
434 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  26.53 
 
 
461 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
521 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
462 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  25.82 
 
 
449 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  26.43 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
466 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  27.72 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
468 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  29.63 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
468 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>