77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2980 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2980  autoaggregation protein  100 
 
 
236 aa  470  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3228  autoaggregation protein  89.52 
 
 
232 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.872821  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4582  autoaggregation protein  82.38 
 
 
235 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.581198  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6333  autoaggregation protein  82.1 
 
 
237 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2286  outer membrane adhesin like proteiin  57.02 
 
 
510 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2620  outer membrane adhesin like proteiin  52.61 
 
 
513 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2314  putative fusion protein: autoaggregation protein and hypothetical conserved protein  55.86 
 
 
261 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.013447  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2238  autoaggregation protein (adhering protein)  43.1 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2017  autoaggregation protein (adhering protein)  43.59 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  32.95 
 
 
2555 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  30.8 
 
 
16322 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3480  outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  30.13 
 
 
3508 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  31.25 
 
 
4748 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  30.59 
 
 
4978 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.71 
 
 
5745 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2256  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  43.43 
 
 
496 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  27.35 
 
 
3714 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.57 
 
 
1599 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3188  outer membrane adhesin like proteiin  36.8 
 
 
277 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
3816 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  44.71 
 
 
541 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2574  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.11 
 
 
497 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.053652  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3227  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  43.53 
 
 
537 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751454  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 
4122 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  32.82 
 
 
3182 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  29.22 
 
 
3229 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.32 
 
 
2768 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  33.33 
 
 
2251 aa  55.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.96 
 
 
2784 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  26.56 
 
 
3259 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.51 
 
 
1883 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2257  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  42.17 
 
 
496 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  26.61 
 
 
3758 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2575  Parallel beta-helix repeat protein  43.37 
 
 
495 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116637  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 
4836 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  28.93 
 
 
9867 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  29.89 
 
 
2887 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.9 
 
 
5098 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  33.33 
 
 
5094 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  38.71 
 
 
4854 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  26.28 
 
 
3191 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  29.33 
 
 
6779 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  28.09 
 
 
2524 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.33 
 
 
6683 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  29.33 
 
 
6662 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.26 
 
 
2239 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  36.56 
 
 
1706 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26.74 
 
 
5020 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  26.46 
 
 
1215 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  26.46 
 
 
1215 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.51 
 
 
2812 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  30.94 
 
 
1586 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  29.02 
 
 
5442 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  28.7 
 
 
4791 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 
5839 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  25.11 
 
 
1268 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  26.91 
 
 
1215 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  27.11 
 
 
1806 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  24.67 
 
 
1269 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.93 
 
 
2816 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.92 
 
 
3038 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  36.76 
 
 
16311 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.8 
 
 
1215 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  27.8 
 
 
1215 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  29.89 
 
 
4285 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.49 
 
 
3026 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.29 
 
 
3552 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.31 
 
 
14916 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.37 
 
 
1553 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  33.06 
 
 
7149 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  26.43 
 
 
1269 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.35 
 
 
2067 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  26.39 
 
 
3824 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.37 
 
 
2839 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 
5787 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.98 
 
 
1066 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>