More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3513 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  48.17 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  45.12 
 
 		 326 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  44.9 
 
 		 315 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  44.86 
 
 		 324 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  41.69 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  41.69 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  41.61 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  40.37 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  40.99 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  42.18 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  44.11 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  38.08 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  43.29 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  42.18 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  38.07 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  36.5 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  36.84 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  38.58 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  35.57 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  33.91 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  36.18 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  34.35 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  37.54 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  36.36 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.93 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  36.26 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  36.23 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.39 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.44 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  35.65 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  33.67 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.13 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  35.33 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  36.65 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.87 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  33.74 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.35 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.2 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.46 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  41.13 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  38.36 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  34.12 
 
 		 318 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.06 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  39.02 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  37.85 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  34.96 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  35.49 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.08 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.43 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.42 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.78 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.25 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.52 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.87 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  35.12 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  32.21 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  32.91 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.29 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  34.14 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  34.94 
 
 		 347 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.28 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  34.31 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  36.75 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  38.17 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.34 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  31.94 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  34.7 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  39.85 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.63 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  38.4 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  33.01 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  35.99 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  34.7 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.7 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  39.86 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  34.62 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  37.59 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  35.23 
 
 		 351 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  33.86 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  34.35 
 
 		 324 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.66 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  40.07 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  33.45 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  35.15 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  35.12 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  38.2 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  35.12 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>