More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1919 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1919  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 299 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6182  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5135  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5310  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5943  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.180862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.95 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6089  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1029  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.850278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 419 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 338 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 331 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  32.1 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 408 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  33.19 
 
 		 308 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 417 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3116  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 316 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  21.75 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.61 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.61 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.61 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  32.1 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>