124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1226 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  51.16 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  47.22 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  48.37 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  47.22 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  45.12 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  47.44 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  47.91 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  45.83 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  47.91 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  45.83 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  43.06 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  46.98 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  47.91 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  47.91 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  45.58 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  47.44 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  47.44 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  46.98 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  45.83 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  41.78 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  43.72 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  45.83 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  42.25 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  41.31 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  41.31 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  42.52 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  41.47 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  42.06 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  42.45 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  41.23 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  40.74 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  40.93 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  40.55 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  47.44 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  41.78 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  41.71 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  43.26 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  46.67 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  46.33 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  43.9 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  40.48 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  42.59 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  43.72 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  43.72 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  43.72 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  43.72 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  43.72 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  43.72 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  42.33 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  45.24 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  44.29 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  38.68 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  37.26 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  40.19 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  41.08 
 
 		 233 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  41.86 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  41.31 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  38.6 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  42.79 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  42.79 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  42.79 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  42.79 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  42.79 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  36.74 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  42.48 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  42.05 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  34.87 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  41.54 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  33.33 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  41.13 
 
 		 141 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  27.43 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  41.79 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  28.17 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  43.24 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  27.23 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  38.16 
 
 		 108 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  29.93 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  29.93 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  29.93 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  46.27 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  36.36 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  26.42 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  24.51 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  28.08 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  33.03 
 
 		 275 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  26.14 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  27.81 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2979  transport-associated protein  45.45 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.484552  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  33.02 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0141  transport-associated  40.58 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  27.14 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  34.26 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  27.41 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  27.03 
 
 		 628 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1367  periplasmic or secreted lipoprotein  31.03 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.487396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  32.08 
 
 		 182 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  32.08 
 
 		 182 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  32.08 
 
 		 182 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  32.08 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>