132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2732 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2732  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 100 aa  203  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2664  regulatory protein, ArsR  83 
 
 		 100 aa  178  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.530465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0946  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0377  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6304  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0540  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2833  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139063  normal  0.779996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0302  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.919233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0461  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000195997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  35.05 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6111  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4239  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2551  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3079  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3936  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.582922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4418  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2026  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  29.9 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1706  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0907  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.246186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0974  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0630999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1932  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001410  putative regulatory protein ArsR family  31.65 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2432  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00680056  normal  0.462104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0945  transcriptional regulator, ArsR family  26.19 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  40.3 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0850  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00475  transcriptional regulator, ArsR family protein  31.88 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.727712  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  38.81 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 116 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  32 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0048  transcriptional regulator, ArsR family protein  30 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0663056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 103 aa  42  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1314  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0732497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  29.67 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  31.63 
 
 		 120 aa  42  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3271  transcriptional regulator, ArsR family  33.75 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  27.37 
 
 		 97 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 136 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3309  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0011324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3471  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 130 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.199985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 113 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>