257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1572 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 250 aa  501  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  75.6 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  48.04 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  33.01 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  28.08 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  29.65 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  34.91 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  27.91 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  26.03 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  37.38 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.4 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  28.77 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  35.57 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  24 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  36.45 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  28.36 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  32.59 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  41.07 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  29.58 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  35.51 
 
 		 221 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  29.44 
 
 		 245 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  31.97 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  36.45 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  32.74 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  29.8 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.63 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  27.01 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  27.01 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.54 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  25.95 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  27.11 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  26.58 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  33.91 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  33.91 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  33.91 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  33.91 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  33.91 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  33.91 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  29.61 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25.95 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  25.95 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  24.03 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  27.06 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  25.95 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.95 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  25.95 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  29.6 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  34.58 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  25.95 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  26.58 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  26.99 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  30.56 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.34 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  29.5 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  29.53 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  30.51 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  20.54 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.67 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  25.32 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  33.91 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  35.24 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  29.78 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35.9 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  29.71 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  33.06 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  33.82 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  32.26 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  27.01 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  35.09 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  25.9 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  29.69 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  29.61 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  24.66 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  25.54 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  27.5 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  27.21 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  30.12 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0379  electron transport protein SCO1/SenC  26.25 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>