More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1044 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1044  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1040  LuxR family transcriptional regulator  97.59 
 
 		 216 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  42.62 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  42.62 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 215 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  43.33 
 
 		 242 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  42.37 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  40.98 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 981 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 905 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 215 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.94 
 
 		 881 aa  50.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  35.44 
 
 		 219 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 245 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 884 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  35.06 
 
 		 217 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 249 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 998 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 235 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 233 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 245 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 386 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 865 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 894 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 231 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 921 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4139  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  46.97 
 
 		 921 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  46.97 
 
 		 921 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 938 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4179  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3672  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 214 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  37.29 
 
 		 884 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 864 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  32.5 
 
 		 90 aa  47.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 364 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0156  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.749313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  42.62 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  42.62 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  35.48 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 918 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01731  LuxR family regulatory protein  35.48 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 876 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1067  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.506731 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01711  LuxR family regulatory protein  35.48 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  36.07 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  41.82 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 912 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  35.48 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  35.48 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 210 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 216 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 229 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 228 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  41.82 
 
 		 228 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>