91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2973 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  88.67 
 
 		 219 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  87.68 
 
 		 219 aa  370  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  68.47 
 
 		 222 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  68.47 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  47.21 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  48.64 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  50.25 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  50.25 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.214156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0783  pilus assembly protein, PilO  49 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  46.63 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  45.81 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  46.31 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0998  pilus assembly protein, PilO  48.56 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  42.57 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0020  pilus assembly protein, PilO  41.67 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  40.7 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  43.81 
 
 		 205 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  44.66 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  44.05 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  32.49 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  36.54 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  33.5 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  33.5 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  31.66 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  30.58 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  33.51 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  28.91 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  37.1 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  28.35 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  30.15 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  33.7 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  31.35 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  34.78 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  34.57 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  31.89 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  34.39 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  30.35 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  29 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  32.92 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  29.41 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  34.84 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  32.91 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3897  pilus assembly protein, PilO  27.23 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000635484  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  32.91 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  30.53 
 
 		 194 aa  95.1  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  28.89 
 
 		 203 aa  95.1  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  29.89 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3701  pilus assembly protein, PilO  26.73 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  27.03 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0244  pilus assembly protein, PilO  26.73 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  26.49 
 
 		 207 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  31.75 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  31.49 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0258  pilus assembly protein, PilO  28.49 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  26.78 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4268  pilus assembly protein, PilO  25.13 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.449559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  35.37 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.03 
 
 		 206 aa  89  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  31.18 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  26.5 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  27.03 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  27.03 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4006  Pilus assembly protein PilO  26.24 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  32.14 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2689  hypothetical protein  25.89 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000030695  hitchhiker  0.00743225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3709  pilus assembly protein, PilO  26.49 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00761204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  29.41 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2171  pilus assembly protein, PilO  25 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21566  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  29.94 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1881  type IV pilus biogenesis  24.43 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00049939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.32 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  26.7 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  34.78 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2718  fimbrial assembly protein PilO  27.62 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  29.41 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  30.16 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  27.39 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  28.09 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  29.27 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  27.11 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  25.9 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.3 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  28.48 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  27.54 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  24.84 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4954  hypothetical protein  26.86 
 
 		 333 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  24.66 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1039  hypothetical protein  27.63 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3251  hypothetical protein  26.87 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1463  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  25.24 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00646714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>