72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2201 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  45.71 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  28.89 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  25.87 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  32.7 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  28.4 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  28.74 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  29.65 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  28.57 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  28.04 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  29.32 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  29.44 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  30.37 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  28.5 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  29.84 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  30.34 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  29.32 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  27.92 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  29.45 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  28.74 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  26.88 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  25.26 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  27.37 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  23.56 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  27.37 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  29.59 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  30.71 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.214156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  28.12 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  25.89 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  27.87 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  29.19 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0783  pilus assembly protein, PilO  29.93 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  30.94 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  29.38 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0998  pilus assembly protein, PilO  26.23 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  25.38 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  26.98 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0020  pilus assembly protein, PilO  28.95 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  31.01 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  26.88 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  28.47 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  27.61 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  26.67 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  27.72 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  26.38 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  26.38 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  25 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  24.31 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  27.22 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  29.53 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  22.22 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  22.22 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  25.38 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  24.05 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  26.42 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2718  fimbrial assembly protein PilO  23.91 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  20.62 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  23.68 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  29.8 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  29.77 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  22.22 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2098  hypothetical protein  20.12 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  27.84 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0868  hypothetical protein  25.75 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  26.92 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  29.7 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.92 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.92 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  23.68 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06070  hypothetical protein  25.44 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  22.15 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  24.21 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>