88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1142 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1142  Pilus assembly protein PilO  100 
 
 		 227 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2921  pilus assembly protein, PilO  67.84 
 
 		 223 aa  305  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0674  pilus assembly protein, PilO  68.37 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.214156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0783  pilus assembly protein, PilO  66.67 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0732  pilus assembly protein, PilO  65.16 
 
 		 224 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0701  Pilus assembly protein PilO  64.71 
 
 		 224 aa  284  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5579  pilus assembly protein PilO  65.14 
 
 		 225 aa  271  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0998  pilus assembly protein, PilO  64.44 
 
 		 226 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0020  pilus assembly protein, PilO  60.71 
 
 		 223 aa  264  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3111  fimbrial assembly protein  61.64 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3405  pilus assembly protein PilO  56.65 
 
 		 238 aa  252  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.152027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0212  pilus assembly protein, PilO  51.26 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0836  Pilus assembly protein PilO  50.25 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2973  fimbrial type-4 assembly membrane transmembrane protein  47.76 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3270  pilus assembly protein PilO  48.53 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3133  pilus assembly protein, PilO  48.44 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2904  Pilus assembly protein PilO  46.57 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3251  Pilus assembly protein PilO  46.57 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2459  pilus assembly protein, PilO  51.41 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0204  type IV pilus assembly membrane transmembrane protein  46.5 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.273451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02353  fimbrial assembly membrane protein  38.92 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0249  pilus assembly protein, PilO  41.12 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3238  Pilus assembly protein PilO  37.44 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.674567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1787  pilus assembly protein PilO  35.41 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.521607  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1858  fimbrial assembly membrane protein  34.93 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0178525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0828  pilus assembly protein, PilO  38.59 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5130  type IV pilus biogenesis protein PilO  38.17 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.818389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5779  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  37.23 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0405  pilus assembly protein, PilO  37.63 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.909088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0407  pilus assembly protein, PilO  35.92 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0292492  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66640  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  37.63 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2757  pilus assembly protein, PilO  36.79 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3371  type IV pilus biogenesis protein PilO  34.47 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0327  type 4 fimbrial biogenesis protein PilO  38.5 
 
 		 212 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3026  Pilus assembly protein PilO  42.86 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0235  pilus assembly protein PilO  32.67 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.613869  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0885  Pilus assembly protein PilO  33.01 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0737  fimbrial assembly protein PilO, putative  33.01 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45280  Pilus assembly protein  39.11 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0372  pilus assembly protein, PilO  32.49 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0258  pilus assembly protein, PilO  32.52 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0544  pilus assembly protein, PilO  36.56 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0160  type IV pilus biogenesis protein PilO  36.22 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.546604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0283  type IV pilus biogenesis protein PilO  35.03 
 
 		 206 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4268  pilus assembly protein, PilO  31.53 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.449559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0277  Pilus assembly protein PilO  38.85 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.747419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0337  pilus assembly protein PilO  31.61 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4116  pilus assembly protein PilO  33.98 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3701  pilus assembly protein, PilO  33.17 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.318823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0244  pilus assembly protein, PilO  33.17 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3897  pilus assembly protein, PilO  33.5 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000635484  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0210  pilus assembly protein, PilO  32.86 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216288  hitchhiker  0.0081665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2689  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000030695  hitchhiker  0.00743225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4087  pilus assembly protein PilO  33.01 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4205  pilus assembly protein PilO  33.01 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3709  pilus assembly protein, PilO  32.66 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00761204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4006  Pilus assembly protein PilO  32.16 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0610  pilus assembly protein, PilO  34.95 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12175  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0960  Tfp pilus assembly protein PilO  32.78 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0991  Tfp pilus assembly protein PilO  32.22 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0669  pilus assembly protein, PilO  31.44 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.823764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0469  type IV pilus biogenesis protein PilO  34.34 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0331  pilus assembly protein PilO  32 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0217389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1939  Pilus assembly protein PilO  32.96 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00513  type IV pilus biogenesis protein PilO  32.8 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2718  fimbrial assembly protein PilO  31.02 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2667  Pilus assembly protein PilO  33.33 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000121155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0994  pilus assembly protein, PilO  30.77 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1548  Pilus assembly protein PilO  33.53 
 
 		 199 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2030  type IV pilus biogenesis protein PilO  32.2 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.72092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1812  pilus assembly protein, PilO  31.65 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00031  fimbrial assembly protein PilO  27.04 
 
 		 197 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2209  putative fimbrial assembly protein PilO  29.38 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00186051  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002324  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.7 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0973  pilus assembly protein, PilO  28.82 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1642  Pilus assembly protein PilO  30 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2171  pilus assembly protein, PilO  25.94 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21566  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1881  type IV pilus biogenesis  24.39 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00049939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2136  pilus assembly protein, PilO-like  24.1 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000460184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2201  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  33.57 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0539  pilus assembly protein, PilO  28.26 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0688  type IV pilus biogenesis protein PilO  26.98 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.507617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0677  Pilus assembly protein PilO  25 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0643  type IV pilus biogenesis protein PilO  21.71 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0677  type IV pilus biogenesis protein PilO  24.43 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1982  Tfp pilus assembly protein PilO-like protein  28.07 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0105796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1471  hypothetical protein  21.02 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.229275  normal  0.300377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1039  hypothetical protein  24.85 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>